RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 GSTO1P78417 241 aa22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL6A3P12111 3177 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 HMGCS2P54868 508 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 GORABQ5T7V8 394 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.62■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALPK3Q96L96 1907 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 LDHCP07864 332 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PI16Q6UXB8 463 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA5Q8NB90 893 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAI14Q9P0K7 980 aa22.61■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1W2PPC1 479 aa22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 GNAI3P08754 354 aa22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 STAP2Q9UGK3 403 aa22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L5A8MUK1 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 HMGCRP04035 888 aa22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAP2P40123 477 aa22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TEX11Q8IYF3 940 aa22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.58■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTX1Q13505 466 aa22.57■■□□□ 1.2
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UPK3BP1-201ENST00000428678 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.57■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRCH3Q96II8 777 aa22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM32Q13049 653 aa22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJD2Q9UKL4 321 aa22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPTORQ8N122 1335 aa22.55■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCAMP43121 646 aa22.54■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTMR2Q13614 643 aa22.54■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.54■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF3Q9H094 633 aa22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.53■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLXNB2O15031 1838 aa22.52■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.52■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIB2Q92519 343 aa22.52■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR18Q9BV38 432 aa22.52■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIPA1L1O43166 1804 aa22.52■■□□□ 1.2
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GNAI2P04899 355 aa22.51■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP2B6P20813 491 aa22.51■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 BACE1P56817 501 aa22.51■■□□□ 1.19
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GDF15Q99988 308 aa22.51■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.51■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.51■■□□□ 1.19
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ASNSP08243 561 aa22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLCG2P16885 1265 aa22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.5■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 PEX10O60683 326 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYN1P17600 705 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 BMP8BP34820 402 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 HERVK_113P62684 666 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.49■■□□□ 1.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.49■■□□□ 1.19
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