RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC15A2Q16348 729 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 DDX11Q96FC9 970 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 BRMS1Q9HCU9 246 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF609O15014 1411 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NCAPHQ15003 741 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC102BQ68D86 513 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ST7Q9NRC1 585 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ERICH4A6NGS2 130 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ZBTB22O15209 634 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ARHGAP6O43182 974 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 USP5P45974 858 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 BAG6P46379 1132 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CHRNDQ07001 517 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MNS1Q8NEH6 495 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SERPINB2P05120 415 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 FOSBP53539 338 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ZSCAN26Q16670 478 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.717e-6■■□□□ 11.8
EFTUD2-201ENST00000402521 MYH3P11055 1940 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SMIM22K7EJ46 135 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CIAO1O76071 339 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NOP2P46087 812 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 FUT8Q9BYC5 575 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CASQ1P31415 396 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SCRN1Q12765 414 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SRLQ86TD4 932 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 FSIP1Q8NA03 581 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 USP28Q96RU2 1077 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCF2Q9UG63 623 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 JAK2O60674 1132 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CYP21A2P08686 494 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 ACTN2P35609 894 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 OLFM4Q6UX06 510 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 BRAPQ7Z569 592 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 CNBD1Q8NA66 436 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 RAB21Q9UL25 225 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MYO1CO00159 1063 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 APPP05067 770 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MMP10P09238 476 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 RASGRF1Q13972 1273 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TMC6Q7Z403 805 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 VSTM4Q8IW00 320 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SMARCE1Q969G3 411 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 IFNKQ9P0W0 207 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 MAST3O60307 1309 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 STX10O60499 249 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM139Q8IV31 216 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 NYXQ9GZU5 481 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 STK32BQ9NY57 414 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-201ENST00000402521 SASH3O75995 380 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms