RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WBP1LQ9NX94 342 aa7.91□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM27P14373 513 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOS2P35228 1153 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DGKZQ13574 1117 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C8orf34Q49A92 452 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LILRB2Q8N423 598 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR152Q8TDT2 470 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IER2Q9BTL4 223 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP16Q9Y5T5 823 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.9□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBX4P57082 545 aa7.9□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB33AQ14088 237 aa7.9□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.9□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ESYT3A0FGR9 886 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDGFRBP09619 1106 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L7P0C7H9 530 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKL1Q969V6 931 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDC45O75419 566 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPON2Q9BUD6 331 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NJY4 79 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP5P45974 858 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNQ4P56696 695 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PROSER3Q2NL68 480 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GINM1Q9NU53 330 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DISP2A7MBM2 1401 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNS2Q63HR2 1409 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A1BGP04217 495 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP4CP60510 307 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE3AQ14432 1141 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MORC4Q8TE76 937 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATG3Q9NT62 314 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GYS2P54840 703 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TKFCQ3LXA3 575 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRMD6Q96NE9 622 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM37O94972 964 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ODR4Q5SWX8 454 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PGBD3Q8N328 593 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WNT2BQ93097 391 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EML1O00423 815 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHMP4BP1P59074 171 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SH3BP2P78314 561 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTFR1Q15390 333 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC7Q99615 494 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STARD3NLO95772 234 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXB7P09629 217 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COPS6Q7L5N1 327 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SGSM3Q96HU1 749 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEMA6NI47 508 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFT43Q96FT9 208 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HYPKQ9NX55 129 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPRCP08575 1304 aa7.85□□□□□ -1.15
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