RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 MYBL2P10244 700 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 RXRAP19793 462 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NEDD9Q14511 834 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TNNI3KQ59H18 835 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 RESP18Q5W5W9 173 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MLKLQ8NB16 471 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ALG1Q9BT22 464 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 DACH1Q9UI36 760 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MYH8P13535 1937 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ABCC6O95255 1503 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1B0GTH6 734 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 GPTP24298 496 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CDC25AP30304 524 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ATP1A2P50993 1020 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PPARDQ03181 441 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PDCLQ13371 301 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NBPF3Q9H094 633 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 VEZTQ9HBM0 779 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TFR2Q9UP52 801 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FLT4P35916 1363 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC189A1A4V9 331 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PRC1O43663 620 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MFAP3LO75121 409 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PPP6R2O75170 966 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ELF1P32519 619 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TRDNQ13061 729 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MED15Q96RN5 788 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KDRP35968 1356 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CHUKO15111 745 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ERVK-24P63145 666 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 AMPD2Q01433 879 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PTPAQ15257 358 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KCTD16Q68DU8 428 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KRT40Q6A162 431 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CNGA4Q8IV77 575 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 LINS1Q8NG48 757 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PHKBQ93100 1093 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MIEF2Q96C03 454 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 RUFY1Q96T51 708 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 GYPCP04921 128 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PAX7P23759 505 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGAP25P42331 645 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 AFMP43652 599 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NLRP6P59044 892 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 HAUS7Q99871 368 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 FBXO3Q9UK99 471 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 METP08581 1390 aa7.11□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 N4BP3O15049 544 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF185O15231 689 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CDR1P51861 262 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 GRIN1Q05586 938 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM29Q14134 588 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 CHP1Q99653 195 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 VPS16Q9H269 839 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 PEAK1Q9H792 1746 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRN3-201ENST00000308478 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms