RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626119.2

COPS7A-222, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7A, Length 1,768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.73	□□□□□ -1.33
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
COPS7A-222	ENST00000626119	MT1M	Q8N339	61 aa		6.64	□□□□□ -1.35
COPS7A-222	ENST00000626119	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.49	□□□□□ -1.37
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.49	□□□□□ -1.37
COPS7A-222	ENST00000626119	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.47	□□□□□ -1.37
COPS7A-222	ENST00000626119	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.41	□□□□□ -1.38
COPS7A-222	ENST00000626119	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
COPS7A-222	ENST00000626119	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		6.39	□□□□□ -1.39
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.34	□□□□□ -1.4
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.2	□□□□□ -1.42
COPS7A-222	ENST00000626119	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
COPS7A-222	ENST00000626119	SPRR2E	P22531	72 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COPS7A-222	ENST00000626119	SPRR2B	P35325	72 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COPS7A-222	ENST00000626119	SPRR2A	P35326	72 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COPS7A-222	ENST00000626119	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
COPS7A-222	ENST00000626119	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COPS7A-222	ENST00000626119	MT1A	P04731	61 aa		5.99	□□□□□ -1.45
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.98	□□□□□ -1.45
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.95	□□□□□ -1.46
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.91	□□□□□ -1.46
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.87	□□□□□ -1.47
COPS7A-222	ENST00000626119	SPRR2D	P22532	72 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.65	□□□□□ -1.5
COPS7A-222	ENST00000626119	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.6	□□□□□ -1.51
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.59	□□□□□ -1.51
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COPS7A-222	ENST00000626119	MT3	P25713	68 aa		5.42	□□□□□ -1.54
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.42	□□□□□ -1.54
COPS7A-222	ENST00000626119	NEB	P20929	6669 aa		5.4	□□□□□ -1.54
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.35	□□□□□ -1.55
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COPS7A-222	ENST00000626119	MT4	P47944	62 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COPS7A-222	ENST00000626119	PRM1	P04553	51 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS7A-222	ENST00000626119	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS7A-222	ENST00000626119	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COPS7A-222	ENST00000626119	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.3	□□□□□ -1.72
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.3	□□□□□ -1.72
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.28	□□□□□ -1.72
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.28	□□□□□ -1.72
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS7A-222	ENST00000626119	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.96	□□□□□ -1.78
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS7A-222	ENST00000626119	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.71	□□□□□ -1.81
COPS7A-222	ENST00000626119	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS7A-222	ENST00000626119	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.24	□□□□□ -1.89
COPS7A-222	ENST00000626119	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS7A-222	ENST00000626119	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.17	□□□□□ -1.9
COPS7A-222	ENST00000626119	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
COPS7A-222	ENST00000626119	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.94	□□□□□ -1.94
COPS7A-222	ENST00000626119	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.13	□□□□□ -2.07

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