RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 RYR1P21817 5038 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRJ-207ENST00000613246 MT1AP04731 61 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRJ-207ENST00000613246 LRP2P98164 4655 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-207ENST00000613246 DNHD1Q96M86 4753 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-207ENST00000613246 MUC17Q685J3 4493 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP5-8O75690 187 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRJ-207ENST00000613246 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRJ-207ENST00000613246 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
PTPRJ-207ENST00000613246 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.83□□□□□ -2.12
PTPRJ-207ENST00000613246 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.59□□□□□ -2.16
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