RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.84□□□□□ -1.31
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.84□□□□□ -1.31
TIMM44-210ENST00000599939 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
TIMM44-210ENST00000599939 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.63□□□□□ -1.35
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
TIMM44-210ENST00000599939 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.55□□□□□ -1.36
TIMM44-210ENST00000599939 MT1MQ8N339 61 aa6.54□□□□□ -1.36
TIMM44-210ENST00000599939 MT1GP13640 62 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMM44-210ENST00000599939 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMM44-210ENST00000599939 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMM44-210ENST00000599939 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMM44-210ENST00000599939 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TIMM44-210ENST00000599939 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.17□□□□□ -1.42
TIMM44-210ENST00000599939 MDN1Q9NU22 5596 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMM44-210ENST00000599939 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TIMM44-210ENST00000599939 LCE3BQ5TA77 95 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP12-4P60329 112 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.94□□□□□ -1.46
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-9P26371 169 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMM44-210ENST00000599939 MT1AP04731 61 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
TIMM44-210ENST00000599939 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TIMM44-210ENST00000599939 SPRR2EP22531 72 aa5.74□□□□□ -1.49
TIMM44-210ENST00000599939 SPRR2BP35325 72 aa5.74□□□□□ -1.49
TIMM44-210ENST00000599939 SPRR2AP35326 72 aa5.74□□□□□ -1.49
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.67□□□□□ -1.5
TIMM44-210ENST00000599939 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.65□□□□□ -1.5
TIMM44-210ENST00000599939 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.57□□□□□ -1.52
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.52□□□□□ -1.53
TIMM44-210ENST00000599939 SPRR2DP22532 72 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.41□□□□□ -1.54
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.36□□□□□ -1.55
TIMM44-210ENST00000599939 PRM1P04553 51 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMM44-210ENST00000599939 MT3P25713 68 aa5.25□□□□□ -1.57
TIMM44-210ENST00000599939 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.14□□□□□ -1.59
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.12□□□□□ -1.59
TIMM44-210ENST00000599939 NEBP20929 6669 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.92□□□□□ -1.62
TIMM44-210ENST00000599939 MT4P47944 62 aa4.84□□□□□ -1.63
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.8□□□□□ -1.64
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.78□□□□□ -1.64
TIMM44-210ENST00000599939 LCE4AQ5TA78 99 aa4.76□□□□□ -1.65
TIMM44-210ENST00000599939 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.69□□□□□ -1.66
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.66□□□□□ -1.66
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.6□□□□□ -1.67
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.58□□□□□ -1.68
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1DQ5T752 114 aa4.57□□□□□ -1.68
TIMM44-210ENST00000599939 MUC5ACP98088 5654 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1EQ5T753 118 aa4.31□□□□□ -1.72
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.23□□□□□ -1.73
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.17□□□□□ -1.74
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.14□□□□□ -1.75
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.12□□□□□ -1.75
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1CQ5T751 118 aa4.08□□□□□ -1.76
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.08□□□□□ -1.76
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4□□□□□ -1.77
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-8O75690 187 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM44-210ENST00000599939 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.79□□□□□ -1.8
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.75□□□□□ -1.81
TIMM44-210ENST00000599939 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.57□□□□□ -1.84
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.52□□□□□ -1.85
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.48□□□□□ -1.85
TIMM44-210ENST00000599939 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TIMM44-210ENST00000599939 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.34□□□□□ -1.87
TIMM44-210ENST00000599939 LCE1FQ5T754 118 aa3.33□□□□□ -1.88
TIMM44-210ENST00000599939 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.25□□□□□ -1.89
TIMM44-210ENST00000599939 PHGR1C9JFL3 82 aa3.04□□□□□ -1.92
TIMM44-210ENST00000599939 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
TIMM44-210ENST00000599939 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms