RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.73□□□□□ -1.17
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.73□□□□□ -1.17
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.73□□□□□ -1.17
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.69□□□□□ -1.18
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.66□□□□□ -1.18
EHD4-202ENST00000569223 MT1MQ8N339 61 aa7.65□□□□□ -1.18
EHD4-202ENST00000569223 MT1GP13640 62 aa7.64□□□□□ -1.19
EHD4-202ENST00000569223 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.56□□□□□ -1.2
EHD4-202ENST00000569223 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.55□□□□□ -1.2
EHD4-202ENST00000569223 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.51□□□□□ -1.21
EHD4-202ENST00000569223 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.46□□□□□ -1.22
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.35□□□□□ -1.23
EHD4-202ENST00000569223 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.32□□□□□ -1.24
EHD4-202ENST00000569223 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.13□□□□□ -1.27
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-9P26371 169 aa7.12□□□□□ -1.27
EHD4-202ENST00000569223 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.07□□□□□ -1.28
EHD4-202ENST00000569223 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
EHD4-202ENST00000569223 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
EHD4-202ENST00000569223 SPRR2EP22531 72 aa6.92□□□□□ -1.3
EHD4-202ENST00000569223 SPRR2BP35325 72 aa6.92□□□□□ -1.3
EHD4-202ENST00000569223 SPRR2AP35326 72 aa6.92□□□□□ -1.3
EHD4-202ENST00000569223 MDN1Q9NU22 5596 aa6.92□□□□□ -1.3
EHD4-202ENST00000569223 LCE3BQ5TA77 95 aa6.88□□□□□ -1.31
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.88□□□□□ -1.31
EHD4-202ENST00000569223 MT1AP04731 61 aa6.85□□□□□ -1.31
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP12-4P60329 112 aa6.72□□□□□ -1.33
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.68□□□□□ -1.34
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.64□□□□□ -1.35
EHD4-202ENST00000569223 SPRR2DP22532 72 aa6.64□□□□□ -1.35
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
EHD4-202ENST00000569223 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.46□□□□□ -1.38
EHD4-202ENST00000569223 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.43□□□□□ -1.38
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.4□□□□□ -1.38
EHD4-202ENST00000569223 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.33□□□□□ -1.4
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.2□□□□□ -1.42
EHD4-202ENST00000569223 MT3P25713 68 aa6.15□□□□□ -1.42
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.12□□□□□ -1.43
EHD4-202ENST00000569223 NEBP20929 6669 aa6.07□□□□□ -1.44
EHD4-202ENST00000569223 PRM1P04553 51 aa5.92□□□□□ -1.46
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.85□□□□□ -1.47
EHD4-202ENST00000569223 MT4P47944 62 aa5.81□□□□□ -1.48
EHD4-202ENST00000569223 LCE4AQ5TA78 99 aa5.81□□□□□ -1.48
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.74□□□□□ -1.49
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.69□□□□□ -1.5
EHD4-202ENST00000569223 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.64□□□□□ -1.51
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.63□□□□□ -1.51
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.58□□□□□ -1.52
EHD4-202ENST00000569223 LCE1DQ5T752 114 aa5.54□□□□□ -1.52
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.53□□□□□ -1.52
EHD4-202ENST00000569223 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.49□□□□□ -1.53
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.48□□□□□ -1.53
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.45□□□□□ -1.54
EHD4-202ENST00000569223 LCE1EQ5T753 118 aa5.12□□□□□ -1.59
EHD4-202ENST00000569223 MUC5ACP98088 5654 aa5.07□□□□□ -1.6
EHD4-202ENST00000569223 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.96□□□□□ -1.62
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.87□□□□□ -1.63
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.84□□□□□ -1.63
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
EHD4-202ENST00000569223 LCE1CQ5T751 118 aa4.82□□□□□ -1.64
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.78□□□□□ -1.64
EHD4-202ENST00000569223 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.7□□□□□ -1.66
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-8O75690 187 aa4.6□□□□□ -1.67
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.53□□□□□ -1.68
EHD4-202ENST00000569223 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.49□□□□□ -1.69
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.46□□□□□ -1.69
EHD4-202ENST00000569223 LCE1FQ5T754 118 aa4.43□□□□□ -1.7
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.17□□□□□ -1.74
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.02□□□□□ -1.77
EHD4-202ENST00000569223 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.71□□□□□ -1.81
EHD4-202ENST00000569223 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
EHD4-202ENST00000569223 PHGR1C9JFL3 82 aa3.6□□□□□ -1.83
EHD4-202ENST00000569223 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.49□□□□□ -1.85
EHD4-202ENST00000569223 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.44□□□□□ -2.02
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