RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIB2-231	ENST00000518681	MT1G	P13640	62 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIB2-231	ENST00000518681	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIB2-231	ENST00000518681	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
MIB2-231	ENST00000518681	MT1M	Q8N339	61 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MIB2-231	ENST00000518681	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.94	□□□□□ -1.46
MIB2-231	ENST00000518681	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
MIB2-231	ENST00000518681	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.91	□□□□□ -1.46
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MIB2-231	ENST00000518681	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.86	□□□□□ -1.47
MIB2-231	ENST00000518681	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MIB2-231	ENST00000518681	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIB2-231	ENST00000518681	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.6	□□□□□ -1.51
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIB2-231	ENST00000518681	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIB2-231	ENST00000518681	MT1A	P04731	61 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIB2-231	ENST00000518681	SPRR2E	P22531	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIB2-231	ENST00000518681	SPRR2B	P35325	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIB2-231	ENST00000518681	SPRR2A	P35326	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIB2-231	ENST00000518681	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIB2-231	ENST00000518681	PRM1	P04553	51 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MIB2-231	ENST00000518681	SPRR2D	P22532	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MIB2-231	ENST00000518681	MT3	P25713	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MIB2-231	ENST00000518681	MT4	P47944	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIB2-231	ENST00000518681	NEB	P20929	6669 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.42	□□□□□ -1.7
MIB2-231	ENST00000518681	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.39	□□□□□ -1.71
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MIB2-231	ENST00000518681	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.28	□□□□□ -1.72
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MIB2-231	ENST00000518681	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIB2-231	ENST00000518681	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MIB2-231	ENST00000518681	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
MIB2-231	ENST00000518681	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.48	□□□□□ -1.85
MIB2-231	ENST00000518681	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MIB2-231	ENST00000518681	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MIB2-231	ENST00000518681	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MIB2-231	ENST00000518681	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
MIB2-231	ENST00000518681	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.85	□□□□□ -2.11

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