RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 A8MUN3 132 aa3.18□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.18□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.18□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 S4R3F8 94 aa3.18□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.17□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCA10Q71F78 164 aa3.17□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 PSPHP1O15172 72 aa3.16□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 SEC61GP60059 68 aa3.16□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE1CQ5T751 118 aa3.16□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.16□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 CSAG1Q6PB30 78 aa3.16□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR15LQ9BU68 103 aa3.15□□□□□ -1.91
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.14□□□□□ -1.91
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.09□□□□□ -1.91
MSC-AS1-202ENST00000512290 BRK1Q8WUW1 75 aa3.09□□□□□ -1.91
MSC-AS1-202ENST00000512290 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.08□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRO0628Q9UI54 55 aa3.08□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.08□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GU69 56 aa3.07□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 A6NED7 52 aa3.06□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 H0YAA0 97 aa3.06□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRIPTQ9P021 101 aa3.06□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLAC4Q8WY50 150 aa3.05□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.04□□□□□ -1.92
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.99□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 UQCR11O14957 56 aa2.99□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1XP80297 61 aa2.99□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.99□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.99□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.98□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT4P47944 62 aa2.97□□□□□ -1.93
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GU33 70 aa2.96□□□□□ -1.94
MSC-AS1-202ENST00000512290 P0C880 135 aa2.94□□□□□ -1.94
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.93□□□□□ -1.94
MSC-AS1-202ENST00000512290 PMAIP1Q13794 54 aa2.92□□□□□ -1.94
MSC-AS1-202ENST00000512290 R4GN34 69 aa2.92□□□□□ -1.94
MSC-AS1-202ENST00000512290 M0QZ58 72 aa2.9□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 PP632Q6XCG6 107 aa2.9□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.89□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.88□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.85□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.85□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP5-8O75690 187 aa2.84□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01554Q52M75 96 aa2.84□□□□□ -1.95
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A0D9SG42 100 aa2.82□□□□□ -1.96
MSC-AS1-202ENST00000512290 K7ERS5 55 aa2.81□□□□□ -1.96
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP12-1P59990 96 aa2.78□□□□□ -1.96
MSC-AS1-202ENST00000512290 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.77□□□□□ -1.97
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.76□□□□□ -1.97
MSC-AS1-202ENST00000512290 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.74□□□□□ -1.97
MSC-AS1-202ENST00000512290 ROMO1P60602 79 aa2.73□□□□□ -1.97
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1EP04732 61 aa2.68□□□□□ -1.98
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1GP13640 62 aa2.68□□□□□ -1.98
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.67□□□□□ -1.98
MSC-AS1-202ENST00000512290 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.66□□□□□ -1.98
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.65□□□□□ -1.99
MSC-AS1-202ENST00000512290 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.63□□□□□ -1.99
MSC-AS1-202ENST00000512290 MUC5ACP98088 5654 aa2.6□□□□□ -1.99
MSC-AS1-202ENST00000512290 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1MQ8N339 61 aa2.59□□□□□ -1.99
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.58□□□□□ -2
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.56□□□□□ -2
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP12-4P60329 112 aa2.55□□□□□ -2
MSC-AS1-202ENST00000512290 TNP1P09430 55 aa2.51□□□□□ -2.01
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1LQ93083 61 aa2.49□□□□□ -2.01
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
MSC-AS1-202ENST00000512290 LUZP6Q538Z0 58 aa2.39□□□□□ -2.03
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP12-3P60328 96 aa2.38□□□□□ -2.03
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.26□□□□□ -2.05
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.16□□□□□ -2.06
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.14□□□□□ -2.07
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1AP04731 61 aa2.12□□□□□ -2.07
MSC-AS1-202ENST00000512290 INE1O15225 51 aa1.84□□□□□ -2.11
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHGR1C9JFL3 82 aa1.8□□□□□ -2.12
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRM1P04553 51 aa1.44□□□□□ -2.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.36□□□□□ -2.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms