RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 MT1GP13640 62 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 INE1O15225 51 aa3.65□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 MT1MQ8N339 61 aa3.65□□□□□ -1.82
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.63□□□□□ -1.83
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1-208ENST00000510829 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RABGEF1-208ENST00000510829 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1-208ENST00000510829 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR2BP35325 72 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR2AP35326 72 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGEF1-208ENST00000510829 MDN1Q9NU22 5596 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-9P26371 169 aa3.37□□□□□ -1.87
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RABGEF1-208ENST00000510829 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR2DP22532 72 aa3.3□□□□□ -1.88
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 MT1AP04731 61 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP12-4P60329 112 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1-208ENST00000510829 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3□□□□□ -1.93
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RABGEF1-208ENST00000510829 MT4P47944 62 aa2.93□□□□□ -1.94
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.86□□□□□ -1.95
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.7□□□□□ -1.98
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.57□□□□□ -2
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.28□□□□□ -2.05
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE1CQ5T751 118 aa2.26□□□□□ -2.05
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-8O75690 187 aa2.19□□□□□ -2.06
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RABGEF1-208ENST00000510829 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LCE1FQ5T754 118 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2□□□□□ -2.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1-208ENST00000510829 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PHGR1C9JFL3 82 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1-208ENST00000510829 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
RABGEF1-208ENST00000510829 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.07□□□□□ -2.24
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