RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.56□□□□□ -1.68
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.55□□□□□ -1.68
NISCH-207ENST00000479054 MT1LQ93083 61 aa4.53□□□□□ -1.68
NISCH-207ENST00000479054 MT1EP04732 61 aa4.53□□□□□ -1.68
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.51□□□□□ -1.69
NISCH-207ENST00000479054 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.38□□□□□ -1.71
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.37□□□□□ -1.71
NISCH-207ENST00000479054 MT1MQ8N339 61 aa4.36□□□□□ -1.71
NISCH-207ENST00000479054 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.31□□□□□ -1.72
NISCH-207ENST00000479054 MT3P25713 68 aa4.31□□□□□ -1.72
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.26□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 MT4P47944 62 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.24□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.24□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.22□□□□□ -1.73
NISCH-207ENST00000479054 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.21□□□□□ -1.74
NISCH-207ENST00000479054 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-207ENST00000479054 PRM1P04553 51 aa4.11□□□□□ -1.75
NISCH-207ENST00000479054 USH2AO75445 5202 aa4.11□□□□□ -1.75
NISCH-207ENST00000479054 MT1AP04731 61 aa4.09□□□□□ -1.76
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.03□□□□□ -1.76
NISCH-207ENST00000479054 LCE4AQ5TA78 99 aa4□□□□□ -1.77
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.98□□□□□ -1.77
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NISCH-207ENST00000479054 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.96□□□□□ -1.78
NISCH-207ENST00000479054 KMT2DO14686 5537 aa3.96□□□□□ -1.78
NISCH-207ENST00000479054 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-207ENST00000479054 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
NISCH-207ENST00000479054 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
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NISCH-207ENST00000479054 SSPOA2VEC9 5147 aa3.79□□□□□ -1.8
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NISCH-207ENST00000479054 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.69□□□□□ -1.82
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.68□□□□□ -1.82
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-9P26371 169 aa3.59□□□□□ -1.83
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NISCH-207ENST00000479054 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.43□□□□□ -1.86
NISCH-207ENST00000479054 LCE1CQ5T751 118 aa3.41□□□□□ -1.86
NISCH-207ENST00000479054 LCE1EQ5T753 118 aa3.41□□□□□ -1.86
NISCH-207ENST00000479054 LCE1FQ5T754 118 aa3.41□□□□□ -1.86
NISCH-207ENST00000479054 MDN1Q9NU22 5596 aa3.35□□□□□ -1.87
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NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.24□□□□□ -1.89
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NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.13□□□□□ -1.91
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NISCH-207ENST00000479054 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.64□□□□□ -1.99
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.61□□□□□ -1.99
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.6□□□□□ -1.99
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-8O75690 187 aa2.45□□□□□ -2.02
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.39□□□□□ -2.03
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.27□□□□□ -2.05
NISCH-207ENST00000479054 PHGR1C9JFL3 82 aa2.22□□□□□ -2.05
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.18□□□□□ -2.06
NISCH-207ENST00000479054 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NISCH-207ENST00000479054 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.14□□□□□ -2.07
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.04□□□□□ -2.08
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.95□□□□□ -2.1
NISCH-207ENST00000479054 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.28□□□□□ -2.21
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