RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1LQ93083 61 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1EP04732 61 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1GP13640 62 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRJ-202ENST00000440289 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 MDN1Q9NU22 5596 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP12-4P60329 112 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE3BQ5TA77 95 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1MQ8N339 61 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRR2EP22531 72 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRR2BP35325 72 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRR2AP35326 72 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 PRM1P04553 51 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-9P26371 169 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1AP04731 61 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 SPRR2DP22532 72 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRJ-202ENST00000440289 NEBP20929 6669 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRJ-202ENST00000440289 MT3P25713 68 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRJ-202ENST00000440289 MT4P47944 62 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRJ-202ENST00000440289 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1DQ5T752 114 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRJ-202ENST00000440289 MUC5ACP98088 5654 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE4AQ5TA78 99 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRJ-202ENST00000440289 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1EQ5T753 118 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRJ-202ENST00000440289 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRJ-202ENST00000440289 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1CQ5T751 118 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-8O75690 187 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1FQ5T754 118 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRJ-202ENST00000440289 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 PHGR1C9JFL3 82 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms