RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT2DO14686 5537 aa3.76□□□□□ -1.81
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR2DP22532 72 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-202ENST00000426333 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1LQ93083 61 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1EP04732 61 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-202ENST00000426333 MT3P25713 68 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 PRM1P04553 51 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1MQ8N339 61 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.28□□□□□ -1.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MT4P47944 62 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-202ENST00000426333 MDN1Q9NU22 5596 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1DQ5T752 114 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.19□□□□□ -1.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.19□□□□□ -1.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MT1AP04731 61 aa3.18□□□□□ -1.9
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.17□□□□□ -1.9
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.14□□□□□ -1.91
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.14□□□□□ -1.91
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.14□□□□□ -1.91
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-9P26371 169 aa3.12□□□□□ -1.91
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.01□□□□□ -1.93
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.91□□□□□ -1.94
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.87□□□□□ -1.95
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
EFTUD2-202ENST00000426333 NEBP20929 6669 aa2.84□□□□□ -1.95
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.84□□□□□ -1.95
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE4AQ5TA78 99 aa2.79□□□□□ -1.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1CQ5T751 118 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1EQ5T753 118 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE1FQ5T754 118 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.76□□□□□ -1.97
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.7□□□□□ -1.98
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.66□□□□□ -1.98
EFTUD2-202ENST00000426333 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.54□□□□□ -2
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.51□□□□□ -2.01
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.48□□□□□ -2.01
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.47□□□□□ -2.01
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.44□□□□□ -2.02
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.42□□□□□ -2.02
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.41□□□□□ -2.02
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC5ACP98088 5654 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.3□□□□□ -2.04
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-202ENST00000426333 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.16□□□□□ -2.06
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.12□□□□□ -2.07
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.08□□□□□ -2.08
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-8O75690 187 aa2.06□□□□□ -2.08
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.01□□□□□ -2.09
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.83□□□□□ -2.12
EFTUD2-202ENST00000426333 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.73□□□□□ -2.13
EFTUD2-202ENST00000426333 PHGR1C9JFL3 82 aa1.59□□□□□ -2.16
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.49□□□□□ -2.17
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms