RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.83□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 SPRR2EP22531 72 aa4.81□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 SPRR2BP35325 72 aa4.81□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 SPRR2AP35326 72 aa4.81□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.8□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.78□□□□□ -1.64
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.77□□□□□ -1.65
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP12-4P60329 112 aa4.76□□□□□ -1.65
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.76□□□□□ -1.65
ZBED1-203ENST00000381223 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.69□□□□□ -1.66
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ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.6□□□□□ -1.67
ZBED1-203ENST00000381223 SPRR2DP22532 72 aa4.6□□□□□ -1.67
ZBED1-203ENST00000381223 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.57□□□□□ -1.68
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED1-203ENST00000381223 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.5□□□□□ -1.69
ZBED1-203ENST00000381223 SSPOA2VEC9 5147 aa4.45□□□□□ -1.7
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.44□□□□□ -1.7
ZBED1-203ENST00000381223 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.39□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.35□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.35□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.35□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ZBED1-203ENST00000381223 MT4P47944 62 aa4.25□□□□□ -1.73
ZBED1-203ENST00000381223 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.21□□□□□ -1.74
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.19□□□□□ -1.74
ZBED1-203ENST00000381223 MT1AP04731 61 aa4.17□□□□□ -1.74
ZBED1-203ENST00000381223 PRM1P04553 51 aa4.16□□□□□ -1.74
ZBED1-203ENST00000381223 MT3P25713 68 aa4.14□□□□□ -1.75
ZBED1-203ENST00000381223 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.13□□□□□ -1.75
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.05□□□□□ -1.76
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.99□□□□□ -1.77
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ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
ZBED1-203ENST00000381223 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.94□□□□□ -1.78
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.9□□□□□ -1.78
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.88□□□□□ -1.79
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.87□□□□□ -1.79
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-9P26371 169 aa3.7□□□□□ -1.82
ZBED1-203ENST00000381223 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.65□□□□□ -1.82
ZBED1-203ENST00000381223 NEBP20929 6669 aa3.64□□□□□ -1.83
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.59□□□□□ -1.83
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.55□□□□□ -1.84
ZBED1-203ENST00000381223 LCE4AQ5TA78 99 aa3.54□□□□□ -1.84
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.36□□□□□ -1.87
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ZBED1-203ENST00000381223 MUC5ACP98088 5654 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.19□□□□□ -1.9
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ZBED1-203ENST00000381223 LCE1FQ5T754 118 aa3.09□□□□□ -1.92
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3□□□□□ -1.93
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.95□□□□□ -1.94
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.95□□□□□ -1.94
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.9□□□□□ -1.95
ZBED1-203ENST00000381223 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.78□□□□□ -1.96
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.72□□□□□ -1.97
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.7□□□□□ -1.98
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.62□□□□□ -1.99
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-8O75690 187 aa2.59□□□□□ -2
ZBED1-203ENST00000381223 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.44□□□□□ -2.02
ZBED1-203ENST00000381223 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.34□□□□□ -2.04
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.21□□□□□ -2.06
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.94□□□□□ -2.1
ZBED1-203ENST00000381223 PHGR1C9JFL3 82 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED1-203ENST00000381223 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.9□□□□□ -2.1
ZBED1-203ENST00000381223 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
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