RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 KMT2DO14686 5537 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRU-201ENST00000345512 MT1MQ8N339 61 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRU-201ENST00000345512 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRU-201ENST00000345512 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRU-201ENST00000345512 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRU-201ENST00000345512 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2EP22531 72 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2BP35325 72 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2AP35326 72 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRU-201ENST00000345512 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRU-201ENST00000345512 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRU-201ENST00000345512 PRM1P04553 51 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2DP22532 72 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 MT1AP04731 61 aa4.46□□□□□ -1.69
PTPRU-201ENST00000345512 SSPOA2VEC9 5147 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRU-201ENST00000345512 MT3P25713 68 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRU-201ENST00000345512 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRU-201ENST00000345512 MT4P47944 62 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1DQ5T752 114 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRU-201ENST00000345512 MDN1Q9NU22 5596 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-9P26371 169 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRU-201ENST00000345512 LCE4AQ5TA78 99 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRU-201ENST00000345512 NEBP20929 6669 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRU-201ENST00000345512 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1EQ5T753 118 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRU-201ENST00000345512 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRU-201ENST00000345512 MUC5ACP98088 5654 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRU-201ENST00000345512 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1CQ5T751 118 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRU-201ENST00000345512 LCE1FQ5T754 118 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.57□□□□□ -2
PTPRU-201ENST00000345512 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.56□□□□□ -2
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-8O75690 187 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.02
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRU-201ENST00000345512 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRU-201ENST00000345512 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRU-201ENST00000345512 PHGR1C9JFL3 82 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRU-201ENST00000345512 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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