RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.49□□□□□ -1.53
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SHQ1-201ENST00000325599 LCE1CQ5T751 118 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP5-8O75690 187 aa3.17□□□□□ -1.9
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.09□□□□□ -1.92
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.02□□□□□ -1.93
SHQ1-201ENST00000325599 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.98□□□□□ -1.93
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.92□□□□□ -1.94
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.87□□□□□ -1.95
SHQ1-201ENST00000325599 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.83□□□□□ -1.96
SHQ1-201ENST00000325599 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SHQ1-201ENST00000325599 PHGR1C9JFL3 82 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-201ENST00000325599 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.61□□□□□ -2.15
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