RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 LCE3BQ5TA77 95 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRN1-201ENST00000319331 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
LRRN1-201ENST00000319331 MT1EP04732 61 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRN1-201ENST00000319331 SSPOA2VEC9 5147 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRN1-201ENST00000319331 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.77□□□□□ -1.65
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.73□□□□□ -1.65
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRN1-201ENST00000319331 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRN1-201ENST00000319331 MT1MQ8N339 61 aa4.61□□□□□ -1.67
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.61□□□□□ -1.67
LRRN1-201ENST00000319331 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN1-201ENST00000319331 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRN1-201ENST00000319331 PRM1P04553 51 aa4.51□□□□□ -1.69
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LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.38□□□□□ -1.71
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.3□□□□□ -1.72
LRRN1-201ENST00000319331 MDN1Q9NU22 5596 aa4.28□□□□□ -1.72
LRRN1-201ENST00000319331 SPRR2EP22531 72 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRN1-201ENST00000319331 SPRR2BP35325 72 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRN1-201ENST00000319331 SPRR2AP35326 72 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRN1-201ENST00000319331 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.17□□□□□ -1.74
LRRN1-201ENST00000319331 MT1AP04731 61 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
LRRN1-201ENST00000319331 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRN1-201ENST00000319331 SPRR2DP22532 72 aa4.08□□□□□ -1.76
LRRN1-201ENST00000319331 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.07□□□□□ -1.76
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LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.95□□□□□ -1.78
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.84□□□□□ -1.79
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.78□□□□□ -1.8
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LRRN1-201ENST00000319331 NEBP20929 6669 aa3.7□□□□□ -1.82
LRRN1-201ENST00000319331 LCE1DQ5T752 114 aa3.67□□□□□ -1.82
LRRN1-201ENST00000319331 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.63□□□□□ -1.83
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LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.47□□□□□ -1.85
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.45□□□□□ -1.86
LRRN1-201ENST00000319331 LCE4AQ5TA78 99 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRN1-201ENST00000319331 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.33□□□□□ -1.88
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LRRN1-201ENST00000319331 MUC5ACP98088 5654 aa3.29□□□□□ -1.88
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.07□□□□□ -1.92
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.02□□□□□ -1.93
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.02□□□□□ -1.93
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LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.8□□□□□ -1.96
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.8□□□□□ -1.96
LRRN1-201ENST00000319331 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.77□□□□□ -1.97
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.75□□□□□ -1.97
LRRN1-201ENST00000319331 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.68□□□□□ -1.98
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-8O75690 187 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRN1-201ENST00000319331 LCE1CQ5T751 118 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRN1-201ENST00000319331 LCE1FQ5T754 118 aa2.64□□□□□ -1.99
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.5□□□□□ -2.01
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.36□□□□□ -2.03
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
LRRN1-201ENST00000319331 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.26□□□□□ -2.05
LRRN1-201ENST00000319331 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
LRRN1-201ENST00000319331 PHGR1C9JFL3 82 aa1.97□□□□□ -2.09
LRRN1-201ENST00000319331 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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