RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
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PTPRG-201ENST00000295874 MT1EP04732 61 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.03□□□□□ -1.77
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.94□□□□□ -1.78
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PTPRG-201ENST00000295874 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-9P26371 169 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRG-201ENST00000295874 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRG-201ENST00000295874 MUC5ACP98088 5654 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRG-201ENST00000295874 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PTPRG-201ENST00000295874 PHGR1C9JFL3 82 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-8O75690 187 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRG-201ENST00000295874 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2□□□□□ -2.09
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.91□□□□□ -2.1
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.9□□□□□ -2.11
PTPRG-201ENST00000295874 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.8 ms