RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 MT3P25713 68 aa3.65□□□□□ -1.83
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.58□□□□□ -1.84
UBASH3B-201ENST00000284273 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.58□□□□□ -1.84
UBASH3B-201ENST00000284273 RYR2Q92736 4967 aa3.56□□□□□ -1.84
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC17Q685J3 4493 aa3.55□□□□□ -1.84
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.86□□□□□ -1.95
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.82□□□□□ -1.96
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UBASH3B-201ENST00000284273 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
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UBASH3B-201ENST00000284273 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.28□□□□□ -2.04
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UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.15□□□□□ -2.06
UBASH3B-201ENST00000284273 PHGR1C9JFL3 82 aa2.13□□□□□ -2.07
UBASH3B-201ENST00000284273 MDN1Q9NU22 5596 aa2.11□□□□□ -2.07
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-8O75690 187 aa2.05□□□□□ -2.08
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UBASH3B-201ENST00000284273 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.85□□□□□ -2.11
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.71□□□□□ -2.14
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.67□□□□□ -2.14
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.63□□□□□ -2.15
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
UBASH3B-201ENST00000284273 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.58□□□□□ -2.16
UBASH3B-201ENST00000284273 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.45□□□□□ -2.18
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.43□□□□□ -2.18
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.39□□□□□ -2.19
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.24□□□□□ -2.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.15□□□□□ -2.23
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