RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.19□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.19□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 hDV103S1A0JD37 113 aa4.18□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 A8MUU9 505 aa4.18□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.17□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.17□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 H3BPC8 53 aa4.16□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.16□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 PCOTHQ58A44 107 aa4.16□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.16□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.15□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFS5O43920 106 aa4.15□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 MP68P56378 58 aa4.15□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.15□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.14□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 SNURFQ9Y675 71 aa4.14□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.12□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.12□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 C4orf26Q17RF5 130 aa4.11□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 PRO0628Q9UI54 55 aa4.11□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 H0Y9P7 68 aa4.1□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.09□□□□□ -1.75
ZNF548-208ENST00000597576 M0R2T5 61 aa4.08□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 V9GYY9 64 aa4.08□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.06□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.06□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00208Q96KT6 92 aa4.06□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.06□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.06□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.05□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.04□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.04□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.04□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 SPINK7P58062 85 aa4.03□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 Q1T7F1 81 aa4.03□□□□□ -1.76
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.01□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV2-30P06310 120 aa4.01□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.99□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 Q5W150 140 aa3.99□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.98□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 BRK1Q8WUW1 75 aa3.98□□□□□ -1.77
ZNF548-208ENST00000597576 HRES1P13985 223 aa3.95□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.94□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 MDN1Q9NU22 5596 aa3.93□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 KMT2DO14686 5537 aa3.91□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 MT2AP02795 61 aa3.91□□□□□ -1.78
ZNF548-208ENST00000597576 DMAC1Q96GE9 116 aa3.9□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 MT1FP04733 61 aa3.89□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.89□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 COA5Q86WW8 74 aa3.89□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 A8MUN3 132 aa3.87□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 PSPHP1O15172 72 aa3.86□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 ACYP2P14621 99 aa3.86□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.85□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 PMAIP1Q13794 54 aa3.85□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.84□□□□□ -1.79
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.83□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 Q5VV11 94 aa3.83□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 PRR15LQ9BU68 103 aa3.83□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.83□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 S4R3F8 94 aa3.82□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 A6NED7 52 aa3.81□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.8□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-9P26371 169 aa3.78□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 SEC61GP60059 68 aa3.78□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 CSAG1Q6PB30 78 aa3.78□□□□□ -1.8
ZNF548-208ENST00000597576 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.76□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP10-10P60014 251 aa3.75□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.75□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.75□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 LCA10Q71F78 164 aa3.73□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 H3BS24 57 aa3.72□□□□□ -1.81
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GU69 56 aa3.69□□□□□ -1.82
ZNF548-208ENST00000597576 A6NN06 94 aa3.69□□□□□ -1.82
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.67□□□□□ -1.82
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.67□□□□□ -1.82
ZNF548-208ENST00000597576 UQCR11O14957 56 aa3.66□□□□□ -1.82
ZNF548-208ENST00000597576 H0YAA0 97 aa3.65□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.65□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.64□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 CRIPTQ9P021 101 aa3.63□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.62□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 A8MU10 97 aa3.61□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.59□□□□□ -1.83
ZNF548-208ENST00000597576 R4GN34 69 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GU33 70 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2EP22531 72 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2BP35325 72 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2AP35326 72 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 K7ERS5 55 aa3.51□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.51□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 M0QZ58 72 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 P0C880 135 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01554Q52M75 96 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF548-208ENST00000597576 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.46□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms