RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB1A1P11684 91 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 OCR1Q9BZK8 76 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 MUC17Q685J3 4493 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 H0Y9P7 68 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCRQO14949 82 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 SPINK7P58062 85 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.1□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.09□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 HRES1P13985 223 aa3.09□□□□□ -1.91
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CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00208Q96KT6 92 aa3.09□□□□□ -1.91
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF213Q63HN8 5207 aa3.08□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.08□□□□□ -1.92
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CAPNS1-208ENST00000589162 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.08□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 KLKP1Q107X0 134 aa3.07□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.07□□□□□ -1.92
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CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 SERP2Q8N6R1 65 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.06□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 MP68P56378 58 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 C20orf197Q8N268 126 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.05□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RQV1 116 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.04□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC179H3BU77 68 aa3.04□□□□□ -1.92
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CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.03□□□□□ -1.92
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM236CP0DP71 79 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.02□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-5P60370 271 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BPC8 53 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 MT1HP80294 61 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-208ENST00000589162 H7BZZ5 65 aa2.95□□□□□ -1.94
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CAPNS1-208ENST00000589162 M0R2T5 61 aa2.93□□□□□ -1.94
CAPNS1-208ENST00000589162 LCA10Q71F78 164 aa2.92□□□□□ -1.94
CAPNS1-208ENST00000589162 DMAC1Q96GE9 116 aa2.92□□□□□ -1.94
CAPNS1-208ENST00000589162 S4R3F8 94 aa2.92□□□□□ -1.94
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.9□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.9□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.89□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFC1O43677 76 aa2.88□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 A8MUN3 132 aa2.87□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 ACYP2P14621 99 aa2.87□□□□□ -1.95
CAPNS1-208ENST00000589162 COA5Q86WW8 74 aa2.87□□□□□ -1.95
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CAPNS1-208ENST00000589162 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
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CAPNS1-208ENST00000589162 CSAG1Q6PB30 78 aa2.83□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.81□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAC1Q96KF2 57 aa2.81□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 PSPHP1O15172 72 aa2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-10P60014 251 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 P0C880 135 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-12P60413 245 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-208ENST00000589162 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 NEBP20929 6669 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 PMAIP1Q13794 54 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 SSPOA2VEC9 5147 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YAA0 97 aa2.72□□□□□ -1.97
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.7□□□□□ -1.98
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CAPNS1-208ENST00000589162 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
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CAPNS1-208ENST00000589162 M0QZ58 72 aa2.69□□□□□ -1.98
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CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.69□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.68□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.67□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01554Q52M75 96 aa2.67□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.66□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 R4GN34 69 aa2.66□□□□□ -1.98
CAPNS1-208ENST00000589162 MT1BP07438 61 aa2.65□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0D9SG42 100 aa2.64□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GU33 70 aa2.64□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 A8MU10 97 aa2.63□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 Q1T7F1 81 aa2.63□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.63□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5VV11 94 aa2.63□□□□□ -1.99
CAPNS1-208ENST00000589162 CRIPTQ9P021 101 aa2.63□□□□□ -1.99
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