RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 HRES1P13985 223 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 SPINK7P58062 85 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GGA3-217ENST00000583667 DMAC1Q96GE9 116 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-217ENST00000583667 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GGA3-217ENST00000583667 A8MUN3 132 aa6.17□□□□□ -1.42
GGA3-217ENST00000583667 ACYP2P14621 99 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-217ENST00000583667 C4orf26Q17RF5 130 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 COA5Q86WW8 74 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 M0R2T5 61 aa6.09□□□□□ -1.43
GGA3-217ENST00000583667 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.08□□□□□ -1.44
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-217ENST00000583667 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GGA3-217ENST00000583667 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-217ENST00000583667 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.98□□□□□ -1.45
GGA3-217ENST00000583667 Q1T7F1 81 aa5.98□□□□□ -1.45
GGA3-217ENST00000583667 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.97□□□□□ -1.45
GGA3-217ENST00000583667 V9GYY9 64 aa5.97□□□□□ -1.45
GGA3-217ENST00000583667 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.95□□□□□ -1.46
GGA3-217ENST00000583667 NEBP20929 6669 aa5.94□□□□□ -1.46
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.94□□□□□ -1.46
GGA3-217ENST00000583667 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.92□□□□□ -1.46
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.89□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 S4R3F8 94 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 LCA10Q71F78 164 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 LCE2BO14633 110 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-217ENST00000583667 CSAG1Q6PB30 78 aa5.79□□□□□ -1.48
GGA3-217ENST00000583667 PRR15LQ9BU68 103 aa5.78□□□□□ -1.48
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GU69 56 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 Q5VV11 94 aa5.77□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 PSPHP1O15172 72 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 SEC61GP60059 68 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 H0YAA0 97 aa5.74□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-217ENST00000583667 MT2AP02795 61 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-217ENST00000583667 UQCR11O14957 56 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 MT1FP04733 61 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GU33 70 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 A6NED7 52 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.59□□□□□ -1.51
GGA3-217ENST00000583667 P0C880 135 aa5.58□□□□□ -1.52
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-10P60014 251 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-217ENST00000583667 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.56□□□□□ -1.52
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GGA3-217ENST00000583667 M0QZ58 72 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-217ENST00000583667 BRK1Q8WUW1 75 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 KMT2DO14686 5537 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 CRIPTQ9P021 101 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 MDN1Q9NU22 5596 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 PRO0628Q9UI54 55 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-217ENST00000583667 A8MU10 97 aa5.43□□□□□ -1.54
GGA3-217ENST00000583667 R4GN34 69 aa5.41□□□□□ -1.54
GGA3-217ENST00000583667 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.38□□□□□ -1.55
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP5-9P26371 169 aa5.36□□□□□ -1.55
GGA3-217ENST00000583667 A6NN06 94 aa5.34□□□□□ -1.55
GGA3-217ENST00000583667 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.34□□□□□ -1.55
GGA3-217ENST00000583667 K7ERS5 55 aa5.3□□□□□ -1.56
GGA3-217ENST00000583667 A0A0D9SG42 100 aa5.29□□□□□ -1.56
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP12-1P59990 96 aa5.29□□□□□ -1.56
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.28□□□□□ -1.56
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.28□□□□□ -1.56
GGA3-217ENST00000583667 SVIPQ8NHG7 77 aa5.27□□□□□ -1.57
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GGA3-217ENST00000583667 KRTAP12-2P59991 146 aa5.24□□□□□ -1.57
GGA3-217ENST00000583667 LINC01554Q52M75 96 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.21□□□□□ -1.58
GGA3-217ENST00000583667 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-217ENST00000583667 SPRR2EP22531 72 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 SPRR2BP35325 72 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 SPRR2AP35326 72 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 PLAC4Q8WY50 150 aa5.11□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 MT1BP07438 61 aa5.09□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 ROMO1P60602 79 aa5.09□□□□□ -1.59
GGA3-217ENST00000583667 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.05□□□□□ -1.6
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GGA3-217ENST00000583667 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.02□□□□□ -1.61
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-5P60370 271 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-217ENST00000583667 C10orf95Q9H7T3 257 aa5□□□□□ -1.61
GGA3-217ENST00000583667 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.97□□□□□ -1.61
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GGA3-217ENST00000583667 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.92□□□□□ -1.62
GGA3-217ENST00000583667 MT1XP80297 61 aa4.91□□□□□ -1.62
GGA3-217ENST00000583667 LCE3BQ5TA77 95 aa4.89□□□□□ -1.63
GGA3-217ENST00000583667 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.89□□□□□ -1.63
GGA3-217ENST00000583667 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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