RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580991.1

IFT20-211, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-211ENST00000580991 C8orf87E5RJ46 101 aa7.34□□□□□ -1.23
IFT20-211ENST00000580991 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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IFT20-211ENST00000580991 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT20-211ENST00000580991 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT20-211ENST00000580991 NDUFS5O43920 106 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT20-211ENST00000580991 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT20-211ENST00000580991 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.3□□□□□ -1.24
IFT20-211ENST00000580991 A8MUU9 505 aa7.27□□□□□ -1.25
IFT20-211ENST00000580991 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.24□□□□□ -1.25
IFT20-211ENST00000580991 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.23□□□□□ -1.25
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IFT20-211ENST00000580991 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.2□□□□□ -1.26
IFT20-211ENST00000580991 C4orf26Q17RF5 130 aa7.18□□□□□ -1.26
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.16□□□□□ -1.26
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IFT20-211ENST00000580991 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.15□□□□□ -1.26
IFT20-211ENST00000580991 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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IFT20-211ENST00000580991 DMAC1Q96GE9 116 aa6.96□□□□□ -1.3
IFT20-211ENST00000580991 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.93□□□□□ -1.3
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IFT20-211ENST00000580991 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.91□□□□□ -1.3
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IFT20-211ENST00000580991 A8MUN3 132 aa6.9□□□□□ -1.3
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IFT20-211ENST00000580991 PRR15LQ9BU68 103 aa6.9□□□□□ -1.3
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IFT20-211ENST00000580991 A6NN06 94 aa6.88□□□□□ -1.31
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IFT20-211ENST00000580991 Q5VV11 94 aa6.87□□□□□ -1.31
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP5-9P26371 169 aa6.86□□□□□ -1.31
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IFT20-211ENST00000580991 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.82□□□□□ -1.32
IFT20-211ENST00000580991 A6NED7 52 aa6.76□□□□□ -1.33
IFT20-211ENST00000580991 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.73□□□□□ -1.33
IFT20-211ENST00000580991 A0A1B0GU69 56 aa6.7□□□□□ -1.34
IFT20-211ENST00000580991 MT1BP07438 61 aa6.7□□□□□ -1.34
IFT20-211ENST00000580991 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.7□□□□□ -1.34
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IFT20-211ENST00000580991 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.57□□□□□ -1.36
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IFT20-211ENST00000580991 SPRR2AP35326 72 aa6.55□□□□□ -1.36
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IFT20-211ENST00000580991 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.52□□□□□ -1.37
IFT20-211ENST00000580991 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.52□□□□□ -1.37
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IFT20-211ENST00000580991 A0A1B0GU33 70 aa6.38□□□□□ -1.39
IFT20-211ENST00000580991 CSAG1Q6PB30 78 aa6.36□□□□□ -1.39
IFT20-211ENST00000580991 SPRR2DP22532 72 aa6.34□□□□□ -1.39
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.33□□□□□ -1.4
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.31□□□□□ -1.4
IFT20-211ENST00000580991 H0YAA0 97 aa6.3□□□□□ -1.4
IFT20-211ENST00000580991 CRIPTQ9P021 101 aa6.25□□□□□ -1.41
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IFT20-211ENST00000580991 LCE3BQ5TA77 95 aa6.22□□□□□ -1.41
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IFT20-211ENST00000580991 M0QZ58 72 aa6.06□□□□□ -1.44
IFT20-211ENST00000580991 PRAC1Q96KF2 57 aa6.05□□□□□ -1.44
IFT20-211ENST00000580991 A0A0D9SG42 100 aa6.04□□□□□ -1.44
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IFT20-211ENST00000580991 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.93□□□□□ -1.46
IFT20-211ENST00000580991 R4GN34 69 aa5.91□□□□□ -1.46
IFT20-211ENST00000580991 KRTAP12-1P59990 96 aa5.9□□□□□ -1.46
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