RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985		H0Y9P7	68 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	ATOX1	O00244	68 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TPCN1-223	ENST00000552985	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC00208	Q96KT6	92 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MP68	P56378	58 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MUN3	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985		H3BPC8	53 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFC1	O43677	76 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1B	P07438	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985		Q5VV11	94 aa		5	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985		H0YAA0	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985		A6NN06	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985		P0C880	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	COX7C	P15954	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ACYP2	P14621	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985		R4GN34	69 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985		M0QZ58	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	MT1X	P80297	61 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985		H7BZZ5	65 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM258	P61165	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TPCN1-223	ENST00000552985	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPCN1-223	ENST00000552985	PSPHP1	O15172	72 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	COA5	Q86WW8	74 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	KMT2D	O14686	5537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	NEB	P20929	6669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPCN1-223	ENST00000552985	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0D9SG42	100 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1B0GU33	70 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2E	P22531	72 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2B	P35325	72 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	SPRR2A	P35326	72 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1B0GU69	56 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.37	□□□□□ -1.71

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