RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2DP22532 72 aa2.27□□□□□ -2.05
ZBED6-202ENST00000550078 LCE3AQ5TA76 89 aa2.26□□□□□ -2.05
ZBED6-202ENST00000550078 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.24□□□□□ -2.05
ZBED6-202ENST00000550078 MT4P47944 62 aa2.22□□□□□ -2.05
ZBED6-202ENST00000550078 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.21□□□□□ -2.05
ZBED6-202ENST00000550078 LCE3BQ5TA77 95 aa2.2□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.19□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 LYSTQ99698 3801 aa2.18□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 LCE2CQ5TA81 110 aa2.17□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.17□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
ZBED6-202ENST00000550078 LCE2BO14633 110 aa2.15□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.14□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 MT1HL1P0DM35 61 aa2.12□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP12-4P60329 112 aa2.12□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.12□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.12□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.1□□□□□ -2.07
ZBED6-202ENST00000550078 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.08□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 INE1O15225 51 aa2.08□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.06□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.05□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1DQ5T752 114 aa2.05□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1CQ5T751 118 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1EQ5T753 118 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1FQ5T754 118 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH2Q9P225 4427 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.03□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 MT1GP13640 62 aa2.02□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.02□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 KMT2AQ03164 3969 aa2.01□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.01□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.01□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 MT1HP80294 61 aa2□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.99□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH10Q8IVF4 4471 aa1.97□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa1.97□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.97□□□□□ -2.09
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH17Q9UFH2 4485 aa1.96□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa1.94□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 ANK2Q01484 3957 aa1.94□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.93□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.93□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa1.93□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 MT2AP02795 61 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 PKHD1P08F94 4074 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 VPS13DQ5THJ4 4388 aa1.91□□□□□ -2.1
ZBED6-202ENST00000550078 MT1FP04733 61 aa1.9□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH7Q8WXX0 4024 aa1.89□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 LCE4AQ5TA78 99 aa1.87□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.86□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH6Q9C0G6 4158 aa1.86□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa1.86□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa1.85□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa1.85□□□□□ -2.11
ZBED6-202ENST00000550078 MT3P25713 68 aa1.83□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 FAT1Q14517 4588 aa1.82□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa1.81□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.79□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.79□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.79□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 FAT2Q9NYQ8 4349 aa1.79□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.78□□□□□ -2.12
ZBED6-202ENST00000550078 LOC100996750A0A140TA64 210 aa1.78□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa1.77□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.75□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH11Q96DT5 4516 aa1.74□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.74□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 RYR1P21817 5038 aa1.72□□□□□ -2.13
ZBED6-202ENST00000550078 FAT3Q8TDW7 4589 aa1.71□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 DNHD1Q96M86 4753 aa1.69□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 DNAH9Q9NYC9 4486 aa1.69□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 PRM1P04553 51 aa1.69□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.69□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 PKD1P98161 4303 aa1.68□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.67□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 MYCBP2O75592 4640 aa1.65□□□□□ -2.14
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa1.65□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.65□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.64□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.63□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.62□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.62□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 BIRC6Q9NR09 4857 aa1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 526.1 ms