RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546560.5

FOXG1-AS1-201, FOXG1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FOXG1-AS1, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.75□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.74□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PCOTHQ58A44 107 aa4.73□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.73□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 Q5W150 140 aa4.72□□□□□ -1.65
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BRK1Q8WUW1 75 aa4.71□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.71□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 Q1T7F1 81 aa4.7□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IGKV2-30P06310 120 aa4.69□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 COA5Q86WW8 74 aa4.68□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.67□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.67□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.66□□□□□ -1.66
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.65□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ACYP2P14621 99 aa4.64□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 C9orf92A6NGG3 77 aa4.63□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HRES1P13985 223 aa4.63□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DMAC1Q96GE9 116 aa4.63□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.62□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.61□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A8MUU9 505 aa4.6□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.6□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.6□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.6□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TNXBP22105 4242 aa4.6□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.59□□□□□ -1.67
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.57□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LCA10Q71F78 164 aa4.57□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.57□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PSPHP1O15172 72 aa4.56□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A8MUN3 132 aa4.55□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PRR15LQ9BU68 103 aa4.55□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 Q5VV11 94 aa4.54□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RNF213Q63HN8 5207 aa4.53□□□□□ -1.68
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LRP2P98164 4655 aa4.52□□□□□ -1.69
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.52□□□□□ -1.69
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PRAC1Q96KF2 57 aa4.48□□□□□ -1.69
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 M0R2T5 61 aa4.47□□□□□ -1.69
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPINK7P58062 85 aa4.47□□□□□ -1.69
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.46□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LPAP08519 4548 aa4.45□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A6NED7 52 aa4.45□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.44□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A0A1B0GU69 56 aa4.43□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.42□□□□□ -1.7
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LINC01554Q52M75 96 aa4.4□□□□□ -1.71
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A6NN06 94 aa4.38□□□□□ -1.71
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MUC2Q02817 5179 aa4.38□□□□□ -1.71
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 UQCR11O14957 56 aa4.34□□□□□ -1.71
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A8MU10 97 aa4.33□□□□□ -1.72
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MT1HP80294 61 aa4.33□□□□□ -1.72
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.32□□□□□ -1.72
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.3□□□□□ -1.72
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.29□□□□□ -1.72
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 S4R3F8 94 aa4.26□□□□□ -1.73
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.24□□□□□ -1.73
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A0A1B0GU33 70 aa4.23□□□□□ -1.73
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 H0YAA0 97 aa4.18□□□□□ -1.74
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.18□□□□□ -1.74
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MUC17Q685J3 4493 aa4.17□□□□□ -1.74
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.17□□□□□ -1.74
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.16□□□□□ -1.74
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.15□□□□□ -1.75
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP10-10P60014 251 aa4.14□□□□□ -1.75
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CSAG1Q6PB30 78 aa4.14□□□□□ -1.75
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 K7ERS5 55 aa4.1□□□□□ -1.75
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.09□□□□□ -1.75
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NDUFAF8A1L188 74 aa4.08□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.08□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ROMO1P60602 79 aa4.07□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 P0C880 135 aa4.06□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MT2AP02795 61 aa4.04□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.04□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 M0QZ58 72 aa4.03□□□□□ -1.76
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 A0A0D9SG42 100 aa3.99□□□□□ -1.77
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MT1FP04733 61 aa3.99□□□□□ -1.77
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.98□□□□□ -1.77
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LUZP6Q538Z0 58 aa3.93□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.93□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 R4GN34 69 aa3.93□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MT3P25713 68 aa3.92□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP12-1P59990 96 aa3.92□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP12-2P59991 146 aa3.9□□□□□ -1.79
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.9□□□□□ -1.79
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CRIPTQ9P021 101 aa3.89□□□□□ -1.79
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.88□□□□□ -1.79
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.83□□□□□ -1.8
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.78□□□□□ -1.8
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.76□□□□□ -1.81
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PLAC4Q8WY50 150 aa3.73□□□□□ -1.81
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.72□□□□□ -1.81
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.71□□□□□ -1.82
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 USH2AO75445 5202 aa3.7□□□□□ -1.82
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms