RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.71□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 S4R3F8 94 aa2.71□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.71□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 MT2AP02795 61 aa2.7□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 MP68P56378 58 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.69□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.68□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 A8MUN3 132 aa2.67□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 MT1FP04733 61 aa2.67□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.67□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 H0Y9P7 68 aa2.66□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFC1O43677 76 aa2.66□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 C5orf47Q569G3 176 aa2.66□□□□□ -1.98
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BPC8 53 aa2.65□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.65□□□□□ -1.99
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CLSTN3-215ENST00000544584 LCA10Q71F78 164 aa2.63□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 CRIPTQ9P021 101 aa2.63□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 KMT2DO14686 5537 aa2.62□□□□□ -1.99
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CLSTN3-215ENST00000544584 SVIPQ8NHG7 77 aa2.62□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00208Q96KT6 92 aa2.62□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.62□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087WVE0 104 aa2.61□□□□□ -1.99
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CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.61□□□□□ -1.99
CLSTN3-215ENST00000544584 C20orf197Q8N268 126 aa2.6□□□□□ -1.99
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CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.59□□□□□ -1.99
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CLSTN3-215ENST00000544584 COX7CP15954 63 aa2.58□□□□□ -2
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CLSTN3-215ENST00000544584 KLKP1Q107X0 134 aa2.58□□□□□ -2
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.58□□□□□ -2
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CLSTN3-215ENST00000544584 LCE4AQ5TA78 99 aa2.47□□□□□ -2.01
CLSTN3-215ENST00000544584 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.47□□□□□ -2.01
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.46□□□□□ -2.02
CLSTN3-215ENST00000544584 H7BZZ5 65 aa2.45□□□□□ -2.02
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CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.45□□□□□ -2.02
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CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.44□□□□□ -2.02
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CLSTN3-215ENST00000544584 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.42□□□□□ -2.02
CLSTN3-215ENST00000544584 V9GYY9 64 aa2.42□□□□□ -2.02
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CLSTN3-215ENST00000544584 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.36□□□□□ -2.03
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CLSTN3-215ENST00000544584 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.34□□□□□ -2.03
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CLSTN3-215ENST00000544584 MT1XP80297 61 aa2.32□□□□□ -2.04
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.32□□□□□ -2.04
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRR2DP22532 72 aa2.31□□□□□ -2.04
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.31□□□□□ -2.04
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GU33 70 aa2.3□□□□□ -2.04
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GU69 56 aa2.29□□□□□ -2.04
CLSTN3-215ENST00000544584 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0D9SG42 100 aa2.25□□□□□ -2.05
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.25□□□□□ -2.05
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