RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 Q5W150 140 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 MP68P56378 58 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 MT1BP07438 61 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 H0Y9P7 68 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 H3BPC8 53 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 Q5VV11 94 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-210ENST00000527027 C4orf26Q17RF5 130 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP5-9P26371 169 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-5P60370 271 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 MDN1Q9NU22 5596 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 KMT2DO14686 5537 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-210ENST00000527027 SERP2Q8N6R1 65 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00208Q96KT6 92 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRU-210ENST00000527027 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRU-210ENST00000527027 CSAG1Q6PB30 78 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRU-210ENST00000527027 S4R3F8 94 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRU-210ENST00000527027 COX7CP15954 63 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-210ENST00000527027 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRU-210ENST00000527027 LCA10Q71F78 164 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRU-210ENST00000527027 KLKP1Q107X0 134 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRU-210ENST00000527027 C20orf197Q8N268 126 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRU-210ENST00000527027 A8MUN3 132 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRU-210ENST00000527027 NDUFC1O43677 76 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRU-210ENST00000527027 SNURFQ9Y675 71 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRU-210ENST00000527027 CRIPTQ9P021 101 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRU-210ENST00000527027 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 DMAC1Q96GE9 116 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2EP22531 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2BP35325 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2AP35326 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 ACYP2P14621 99 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC179H3BU77 68 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-210ENST00000527027 H7BZZ5 65 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRU-210ENST00000527027 H0YAA0 97 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRU-210ENST00000527027 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM258P61165 79 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-210ENST00000527027 MT1XP80297 61 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-210ENST00000527027 PCP4P48539 62 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRU-210ENST00000527027 SPRR2DP22532 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRU-210ENST00000527027 PLAC4Q8WY50 150 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP12-2P59991 146 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRU-210ENST00000527027 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRU-210ENST00000527027 COA5Q86WW8 74 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRU-210ENST00000527027 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRU-210ENST00000527027 R4GN34 69 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRU-210ENST00000527027 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRU-210ENST00000527027 SEC61GP60059 68 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRU-210ENST00000527027 M0QZ58 72 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRU-210ENST00000527027 P0C880 135 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-12P60413 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01554Q52M75 96 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 PRR15LQ9BU68 103 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1B0GU69 56 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRU-210ENST00000527027 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRU-210ENST00000527027 V9GYY9 64 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRU-210ENST00000527027 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1B0GU33 70 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-210ENST00000527027 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-210ENST00000527027 Q1T7F1 81 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-210ENST00000527027 UQCR11O14957 56 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRU-210ENST00000527027 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRU-210ENST00000527027 PSPHP1O15172 72 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-210ENST00000527027 A0A0D9SG42 100 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRU-210ENST00000527027 MT1EP04732 61 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-210ENST00000527027 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-210ENST00000527027 A6NED7 52 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-210ENST00000527027 LCE1DQ5T752 114 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-210ENST00000527027 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRU-210ENST00000527027 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRU-210ENST00000527027 A8MU10 97 aa5.94□□□□□ -1.46
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