RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.23□□□□□ -1.89
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.23□□□□□ -1.89
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.22□□□□□ -1.89
ARHGEF3-215ENST00000498517 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ARHGEF3-215ENST00000498517 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.21□□□□□ -1.89
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.21□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCOTHQ58A44 107 aa3.21□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf195Q5TG92 126 aa3.21□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 C8orf87E5RJ46 101 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPINK1P00995 79 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCE1FQ5T754 118 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 COA5Q86WW8 74 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMD2Q9BT23 127 aa3.2□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.19□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSPHP1O15172 72 aa3.19□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP5-9P26371 169 aa3.19□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.19□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MUN3 132 aa3.18□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP10-8P60410 259 aa3.18□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP10-12P60413 245 aa3.17□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRR15LQ9BU68 103 aa3.17□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUC2Q02817 5179 aa3.16□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.16□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q5VV11 94 aa3.16□□□□□ -1.9
ARHGEF3-215ENST00000498517 HRES1P13985 223 aa3.15□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q5W150 140 aa3.15□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.14□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.14□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00313P59037 77 aa3.14□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q75L30 129 aa3.14□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.14□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.12□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF213Q63HN8 5207 aa3.12□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNXBP22105 4242 aa3.11□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.11□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACYP2P14621 99 aa3.11□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 A6NED7 52 aa3.1□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 MT1HL1P0DM35 61 aa3.1□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 DMAC1Q96GE9 116 aa3.1□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.09□□□□□ -1.91
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYCBP2O75592 4640 aa3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCA10Q71F78 164 aa3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MU10 97 aa3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 PMAIP1Q13794 54 aa3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 C9orf92A6NGG3 77 aa3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPINK7P58062 85 aa3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GU69 56 aa3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.02□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.01□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.01□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 A6NN06 94 aa3.01□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.01□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.01□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 A8MUU9 505 aa2.99□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPRXLQ17RH7 258 aa2.99□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.98□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.98□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.98□□□□□ -1.93
ARHGEF3-215ENST00000498517 UQCR11O14957 56 aa2.96□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC61GP60059 68 aa2.96□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.96□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 LPAP08519 4548 aa2.92□□□□□ -1.94
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0A0MQY5 61 aa2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRP2P98164 4655 aa2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GU33 70 aa2.86□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.86□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.86□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUC17Q685J3 4493 aa2.85□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRAC1Q96KF2 57 aa2.85□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 H0YAA0 97 aa2.84□□□□□ -1.95
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.83□□□□□ -1.96
ARHGEF3-215ENST00000498517 K7ERS5 55 aa2.8□□□□□ -1.96
ARHGEF3-215ENST00000498517 S4R3F8 94 aa2.79□□□□□ -1.96
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSAG1Q6PB30 78 aa2.78□□□□□ -1.96
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC01554Q52M75 96 aa2.77□□□□□ -1.97
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.77□□□□□ -1.97
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.77□□□□□ -1.97
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.72□□□□□ -1.97
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0R2T5 61 aa2.71□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 ROMO1P60602 79 aa2.71□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.71□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCE3AQ5TA76 89 aa2.71□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0D9SG42 100 aa2.69□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 P0C880 135 aa2.69□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.67□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0QZ58 72 aa2.66□□□□□ -1.98
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.1 ms