RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MT1HL1P0DM35 61 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 TPRXLQ17RH7 258 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP10-8P60410 259 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZRX8 168 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-213ENST00000496055 FAT1Q14517 4588 aa2.53□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0G2JQZ4 141 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 H0YAA0 97 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 XP32Q5T750 250 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 MYCBP2O75592 4640 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 R4GN34 69 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 LCE4AQ5TA78 99 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 HERC1Q15751 4861 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.46□□□□□ -2.01
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFL1Q6UW32 110 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 SPINK1P00995 79 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 PRLHP81277 87 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 PLAC4Q8WY50 150 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R2T5 61 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF213Q63HN8 5207 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 SPRR1AP35321 89 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP2P98164 4655 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 INE1O15225 51 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 TNXBP22105 4242 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf92A6NGG3 77 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV2-30P06310 120 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 LCE3BQ5TA77 95 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 SPRR1BP22528 89 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-213ENST00000496055 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP12-2P59991 146 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0D9SG42 100 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 S4R3F8 94 aa2.21□□□□□ -2.05
RABGGTB-213ENST00000496055 MUC17Q685J3 4493 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 MT1HP80294 61 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 LPAP08519 4548 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 PP632Q6XCG6 107 aa2.15□□□□□ -2.06
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP10-10P60014 251 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 LCE1DQ5T752 114 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP12-1P59990 96 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-213ENST00000496055 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.09□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 MUC2Q02817 5179 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 MT2AP02795 61 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 MT1FP04733 61 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa1.98□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-213ENST00000496055 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms