RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 MP68P56378 58 aa8.6□□□□□ -1.03
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.59□□□□□ -1.03
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.58□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 MT-ATP8P03928 68 aa8.56□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 H3BPC8 53 aa8.55□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.53□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.53□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.53□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.53□□□□□ -1.04
SSC4D-202ENST00000492979 LINC00208Q96KT6 92 aa8.52□□□□□ -1.05
SSC4D-202ENST00000492979 KLKP1Q107X0 134 aa8.49□□□□□ -1.05
SSC4D-202ENST00000492979 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSC4D-202ENST00000492979 MT1BP07438 61 aa8.47□□□□□ -1.05
SSC4D-202ENST00000492979 CRIPTQ9P021 101 aa8.46□□□□□ -1.06
SSC4D-202ENST00000492979 A8MUN3 132 aa8.44□□□□□ -1.06
SSC4D-202ENST00000492979 H0YAA0 97 aa8.43□□□□□ -1.06
SSC4D-202ENST00000492979 Q5VV11 94 aa8.43□□□□□ -1.06
SSC4D-202ENST00000492979 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.42□□□□□ -1.06
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.39□□□□□ -1.07
SSC4D-202ENST00000492979 NDUFC1O43677 76 aa8.37□□□□□ -1.07
SSC4D-202ENST00000492979 A6NN06 94 aa8.33□□□□□ -1.08
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP10-5P60370 271 aa8.31□□□□□ -1.08
SSC4D-202ENST00000492979 SERP2Q8N6R1 65 aa8.26□□□□□ -1.09
SSC4D-202ENST00000492979 DMAC1Q96GE9 116 aa8.22□□□□□ -1.09
SSC4D-202ENST00000492979 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.15□□□□□ -1.1
SSC4D-202ENST00000492979 ACYP2P14621 99 aa8.14□□□□□ -1.11
SSC4D-202ENST00000492979 C20orf197Q8N268 126 aa8.14□□□□□ -1.11
SSC4D-202ENST00000492979 SNURFQ9Y675 71 aa8.13□□□□□ -1.11
SSC4D-202ENST00000492979 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.1□□□□□ -1.11
SSC4D-202ENST00000492979 COX7CP15954 63 aa8.09□□□□□ -1.11
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-9P26371 169 aa8.05□□□□□ -1.12
SSC4D-202ENST00000492979 NEBP20929 6669 aa8.05□□□□□ -1.12
SSC4D-202ENST00000492979 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.03□□□□□ -1.12
SSC4D-202ENST00000492979 P0C880 135 aa7.99□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.99□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.99□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 R4GN34 69 aa7.98□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.98□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.97□□□□□ -1.13
SSC4D-202ENST00000492979 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.96□□□□□ -1.14
SSC4D-202ENST00000492979 MT1XP80297 61 aa7.94□□□□□ -1.14
SSC4D-202ENST00000492979 PLAC4Q8WY50 150 aa7.94□□□□□ -1.14
SSC4D-202ENST00000492979 KMT2DO14686 5537 aa7.89□□□□□ -1.15
SSC4D-202ENST00000492979 M0QZ58 72 aa7.87□□□□□ -1.15
SSC4D-202ENST00000492979 H7BZZ5 65 aa7.85□□□□□ -1.15
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP12-2P59991 146 aa7.85□□□□□ -1.15
SSC4D-202ENST00000492979 MDN1Q9NU22 5596 aa7.8□□□□□ -1.16
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.77□□□□□ -1.17
SSC4D-202ENST00000492979 COA5Q86WW8 74 aa7.77□□□□□ -1.17
SSC4D-202ENST00000492979 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.76□□□□□ -1.17
SSC4D-202ENST00000492979 CCDC179H3BU77 68 aa7.71□□□□□ -1.18
SSC4D-202ENST00000492979 LINC01554Q52M75 96 aa7.68□□□□□ -1.18
SSC4D-202ENST00000492979 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.65□□□□□ -1.18
SSC4D-202ENST00000492979 SEC61GP60059 68 aa7.64□□□□□ -1.19
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.64□□□□□ -1.19
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP10-12P60413 245 aa7.6□□□□□ -1.19
SSC4D-202ENST00000492979 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.6□□□□□ -1.19
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.56□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 TMEM258P61165 79 aa7.55□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2EP22531 72 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2BP35325 72 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2AP35326 72 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.53□□□□□ -1.2
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.45□□□□□ -1.22
SSC4D-202ENST00000492979 A0A1B0GU69 56 aa7.43□□□□□ -1.22
SSC4D-202ENST00000492979 A0A1B0GU33 70 aa7.41□□□□□ -1.22
SSC4D-202ENST00000492979 PRR15LQ9BU68 103 aa7.36□□□□□ -1.23
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.32□□□□□ -1.24
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.32□□□□□ -1.24
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR2DP22532 72 aa7.29□□□□□ -1.24
SSC4D-202ENST00000492979 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.29□□□□□ -1.24
SSC4D-202ENST00000492979 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.29□□□□□ -1.24
SSC4D-202ENST00000492979 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.26□□□□□ -1.25
SSC4D-202ENST00000492979 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.24□□□□□ -1.25
SSC4D-202ENST00000492979 A0A0D9SG42 100 aa7.2□□□□□ -1.26
SSC4D-202ENST00000492979 PCP4P48539 62 aa7.17□□□□□ -1.26
SSC4D-202ENST00000492979 V9GYY9 64 aa7.16□□□□□ -1.26
SSC4D-202ENST00000492979 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.13□□□□□ -1.27
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP12-1P59990 96 aa7.12□□□□□ -1.27
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.12□□□□□ -1.27
SSC4D-202ENST00000492979 LCE3BQ5TA77 95 aa7.12□□□□□ -1.27
SSC4D-202ENST00000492979 UQCR11O14957 56 aa7.1□□□□□ -1.27
SSC4D-202ENST00000492979 Q1T7F1 81 aa7.06□□□□□ -1.28
SSC4D-202ENST00000492979 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.05□□□□□ -1.28
SSC4D-202ENST00000492979 MT1EP04732 61 aa7.04□□□□□ -1.28
SSC4D-202ENST00000492979 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SSC4D-202ENST00000492979 A8MU10 97 aa7.02□□□□□ -1.29
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7□□□□□ -1.29
SSC4D-202ENST00000492979 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.93□□□□□ -1.3
SSC4D-202ENST00000492979 PSPHP1O15172 72 aa6.92□□□□□ -1.3
SSC4D-202ENST00000492979 MT1GP13640 62 aa6.88□□□□□ -1.31
SSC4D-202ENST00000492979 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.86□□□□□ -1.31
SSC4D-202ENST00000492979 K7ERS5 55 aa6.83□□□□□ -1.32
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