RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 OCR1Q9BZK8 76 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 H0Y9P7 68 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 C5orf47Q569G3 176 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 C4orf26Q17RF5 130 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 Q5VV11 94 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRN-217ENST00000489650 H3BPC8 53 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRN-217ENST00000489650 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00208Q96KT6 92 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-5P60370 271 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP5-9P26371 169 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRN-217ENST00000489650 MDN1Q9NU22 5596 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 S4R3F8 94 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 KMT2DO14686 5537 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 CSAG1Q6PB30 78 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 SERP2Q8N6R1 65 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 LCA10Q71F78 164 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRN-217ENST00000489650 KLKP1Q107X0 134 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRN-217ENST00000489650 A8MUN3 132 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 COX7CP15954 63 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 C20orf197Q8N268 126 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRN-217ENST00000489650 SNURFQ9Y675 71 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFC1O43677 76 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 DMAC1Q96GE9 116 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 CRIPTQ9P021 101 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2EP22531 72 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2BP35325 72 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2AP35326 72 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 ACYP2P14621 99 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRN-217ENST00000489650 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC179H3BU77 68 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRN-217ENST00000489650 H7BZZ5 65 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 MT1XP80297 61 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRN-217ENST00000489650 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 H0YAA0 97 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR2DP22532 72 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 PLAC4Q8WY50 150 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRN-217ENST00000489650 COA5Q86WW8 74 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM258P61165 79 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP12-2P59991 146 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRN-217ENST00000489650 PCP4P48539 62 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRN-217ENST00000489650 R4GN34 69 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRN-217ENST00000489650 LCE3BQ5TA77 95 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRN-217ENST00000489650 P0C880 135 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SEC61GP60059 68 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRN-217ENST00000489650 M0QZ58 72 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRN-217ENST00000489650 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRN-217ENST00000489650 LINC01554Q52M75 96 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-12P60413 245 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GU69 56 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRN-217ENST00000489650 PRR15LQ9BU68 103 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRN-217ENST00000489650 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRN-217ENST00000489650 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GU33 70 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-217ENST00000489650 V9GYY9 64 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-217ENST00000489650 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-217ENST00000489650 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRN-217ENST00000489650 Q1T7F1 81 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRN-217ENST00000489650 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-217ENST00000489650 UQCR11O14957 56 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-217ENST00000489650 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0D9SG42 100 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-217ENST00000489650 PSPHP1O15172 72 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRN-217ENST00000489650 MT1EP04732 61 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRN-217ENST00000489650 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRN-217ENST00000489650 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRN-217ENST00000489650 LCE1DQ5T752 114 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRN-217ENST00000489650 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRN-217ENST00000489650 A8MU10 97 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRN-217ENST00000489650 A6NED7 52 aa6.8□□□□□ -1.32
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