RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 SCGB1A1P11684 91 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-240ENST00000484412 LCA10Q71F78 164 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-240ENST00000484412 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-240ENST00000484412 KLKP1Q107X0 134 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-240ENST00000484412 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-240ENST00000484412 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-240ENST00000484412 H0YAA0 97 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-240ENST00000484412 USH2AO75445 5202 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-240ENST00000484412 NDUFC1O43677 76 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 DMAC1Q96GE9 116 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 CRIPTQ9P021 101 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-240ENST00000484412 SSPOA2VEC9 5147 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-240ENST00000484412 SERP2Q8N6R1 65 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-240ENST00000484412 ACYP2P14621 99 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-240ENST00000484412 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-240ENST00000484412 MT1BP07438 61 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 C20orf197Q8N268 126 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 SNURFQ9Y675 71 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 LCE3BQ5TA77 95 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 COX7CP15954 63 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 Q5VV11 94 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-240ENST00000484412 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-240ENST00000484412 P0C880 135 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-240ENST00000484412 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-240ENST00000484412 H7BZZ5 65 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP10-5P60370 271 aa6.04□□□□□ -1.44
HDLBP-240ENST00000484412 R4GN34 69 aa6.03□□□□□ -1.44
HDLBP-240ENST00000484412 A6NN06 94 aa6.01□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 M0QZ58 72 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 LCE4AQ5TA78 99 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
HDLBP-240ENST00000484412 COA5Q86WW8 74 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-240ENST00000484412 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.96□□□□□ -1.46
HDLBP-240ENST00000484412 PLAC4Q8WY50 150 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.92□□□□□ -1.46
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.89□□□□□ -1.47
HDLBP-240ENST00000484412 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.88□□□□□ -1.47
HDLBP-240ENST00000484412 CCDC179H3BU77 68 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-240ENST00000484412 MT1XP80297 61 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-240ENST00000484412 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 SEC61GP60059 68 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 LCE1DQ5T752 114 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01554Q52M75 96 aa5.79□□□□□ -1.48
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP12-2P59991 146 aa5.77□□□□□ -1.49
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.76□□□□□ -1.49
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GU33 70 aa5.72□□□□□ -1.49
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP5-9P26371 169 aa5.72□□□□□ -1.49
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM258P61165 79 aa5.71□□□□□ -1.5
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GU69 56 aa5.66□□□□□ -1.5
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP10-12P60413 245 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-240ENST00000484412 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.6□□□□□ -1.51
HDLBP-240ENST00000484412 PRR15LQ9BU68 103 aa5.58□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.57□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.55□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP12-1P59990 96 aa5.54□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.54□□□□□ -1.52
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.52□□□□□ -1.53
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0D9SG42 100 aa5.51□□□□□ -1.53
HDLBP-240ENST00000484412 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.47□□□□□ -1.53
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.47□□□□□ -1.53
HDLBP-240ENST00000484412 KMT2DO14686 5537 aa5.46□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.46□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.45□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 NEBP20929 6669 aa5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 UQCR11O14957 56 aa5.43□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 V9GYY9 64 aa5.42□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 A8MU10 97 aa5.41□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.4□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 Q1T7F1 81 aa5.4□□□□□ -1.54
HDLBP-240ENST00000484412 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
HDLBP-240ENST00000484412 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.36□□□□□ -1.55
HDLBP-240ENST00000484412 PCP4P48539 62 aa5.32□□□□□ -1.56
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR2EP22531 72 aa5.31□□□□□ -1.56
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR2BP35325 72 aa5.31□□□□□ -1.56
HDLBP-240ENST00000484412 SPRR2AP35326 72 aa5.31□□□□□ -1.56
HDLBP-240ENST00000484412 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.29□□□□□ -1.56
HDLBP-240ENST00000484412 MDN1Q9NU22 5596 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms