RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479413.1

C9orf85-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf85, Length 902 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-205ENST00000479413 A0A1B0GVX0 72 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 C5orf47Q569G3 176 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 NDUFB1O75438 58 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 SPINK7P58062 85 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 SNURFQ9Y675 71 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 H3BS24 57 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 H3BPC8 53 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 CASC2Q6XLA1 102 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 MP68P56378 58 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf85-205ENST00000479413 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf85-205ENST00000479413 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf85-205ENST00000479413 hDV103S1A0JD37 113 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf85-205ENST00000479413 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf85-205ENST00000479413 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 H0Y9P7 68 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 LCE1DQ5T752 114 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 LINC00208Q96KT6 92 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf85-205ENST00000479413 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf85-205ENST00000479413 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf85-205ENST00000479413 NDUFS5O43920 106 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf85-205ENST00000479413 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf85-205ENST00000479413 SVIPQ8NHG7 77 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf85-205ENST00000479413 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf85-205ENST00000479413 IGKV2-30P06310 120 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf85-205ENST00000479413 NEBP20929 6669 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 C4orf26Q17RF5 130 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 Q1T7F1 81 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 V9GYY9 64 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 A6NN06 94 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 Q5W150 140 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf85-205ENST00000479413 Q5VV11 94 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf85-205ENST00000479413 COA5Q86WW8 74 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf85-205ENST00000479413 MT1BP07438 61 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 ACYP2P14621 99 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 S4R3F8 94 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 CSAG1Q6PB30 78 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 DMAC1Q96GE9 116 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP10-5P60370 271 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 PRO0628Q9UI54 55 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 LCA10Q71F78 164 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP5-9P26371 169 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf85-205ENST00000479413 A8MUN3 132 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf85-205ENST00000479413 PSPHP1O15172 72 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf85-205ENST00000479413 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 BRK1Q8WUW1 75 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 PRR15LQ9BU68 103 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 KMT2DO14686 5537 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 CRIPTQ9P021 101 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf85-205ENST00000479413 MDN1Q9NU22 5596 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf85-205ENST00000479413 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf85-205ENST00000479413 A6NED7 52 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 A0A1B0GU69 56 aa6.12□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.1□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.1□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf85-205ENST00000479413 SPRR2EP22531 72 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf85-205ENST00000479413 SPRR2BP35325 72 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf85-205ENST00000479413 SPRR2AP35326 72 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf85-205ENST00000479413 H0YAA0 97 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf85-205ENST00000479413 SEC61GP60059 68 aa6.04□□□□□ -1.44
C9orf85-205ENST00000479413 UQCR11O14957 56 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 LCE4AQ5TA78 99 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 ADM2Q7Z4H4 148 aa6□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 A8MU10 97 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 MT1XP80297 61 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 PLAC4Q8WY50 150 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 PMAIP1Q13794 54 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf85-205ENST00000479413 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.93□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.92□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP12-2P59991 146 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf85-205ENST00000479413 R4GN34 69 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.4 ms