RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474181.1

UBE2Q1-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-203ENST00000474181 A0A1B0GU69 56 aa6.7□□□□□ -1.34
UBE2Q1-203ENST00000474181 A6NED7 52 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRO0628Q9UI54 55 aa6.69□□□□□ -1.34
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2Q1-203ENST00000474181 SEC61GP60059 68 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2Q1-203ENST00000474181 MYCBP2O75592 4640 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2Q1-203ENST00000474181 H3BS24 57 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2Q1-203ENST00000474181 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2Q1-203ENST00000474181 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.57□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.56□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.56□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 S4R3F8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.53□□□□□ -1.36
UBE2Q1-203ENST00000474181 UQCR11O14957 56 aa6.52□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 LCA10Q71F78 164 aa6.52□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 HERC1Q15751 4861 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 A8MU10 97 aa6.48□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.47□□□□□ -1.37
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2Q1-203ENST00000474181 A0A1B0GU33 70 aa6.41□□□□□ -1.38
UBE2Q1-203ENST00000474181 PMAIP1Q13794 54 aa6.4□□□□□ -1.38
UBE2Q1-203ENST00000474181 CSAG1Q6PB30 78 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRP2P98164 4655 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2Q1-203ENST00000474181 LPAP08519 4548 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2Q1-203ENST00000474181 H0YAA0 97 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2Q1-203ENST00000474181 A6NN06 94 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UBE2Q1-203ENST00000474181 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.27□□□□□ -1.41
UBE2Q1-203ENST00000474181 MUC17Q685J3 4493 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2Q1-203ENST00000474181 K7ERS5 55 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2Q1-203ENST00000474181 P0C880 135 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2Q1-203ENST00000474181 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2Q1-203ENST00000474181 A0A0D9SG42 100 aa6.14□□□□□ -1.43
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.14□□□□□ -1.43
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.13□□□□□ -1.43
UBE2Q1-203ENST00000474181 M0QZ58 72 aa6.12□□□□□ -1.43
UBE2Q1-203ENST00000474181 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.04□□□□□ -1.44
UBE2Q1-203ENST00000474181 R4GN34 69 aa6.04□□□□□ -1.44
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.99□□□□□ -1.45
UBE2Q1-203ENST00000474181 LINC01554Q52M75 96 aa5.97□□□□□ -1.45
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRAC1Q96KF2 57 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP12-1P59990 96 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP12-2P59991 146 aa5.93□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 ROMO1P60602 79 aa5.93□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 M0R2T5 61 aa5.92□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRIPTQ9P021 101 aa5.9□□□□□ -1.46
UBE2Q1-203ENST00000474181 RNF213Q63HN8 5207 aa5.87□□□□□ -1.47
UBE2Q1-203ENST00000474181 MT1HP80294 61 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2Q1-203ENST00000474181 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.77□□□□□ -1.49
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.74□□□□□ -1.49
UBE2Q1-203ENST00000474181 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.73□□□□□ -1.49
UBE2Q1-203ENST00000474181 MUC2Q02817 5179 aa5.72□□□□□ -1.49
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP10-10P60014 251 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2Q1-203ENST00000474181 MT2AP02795 61 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-203ENST00000474181 MT1FP04733 61 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLAC4Q8WY50 150 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.54□□□□□ -1.52
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.48□□□□□ -1.53
UBE2Q1-203ENST00000474181 TNP1P09430 55 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-203ENST00000474181 A0A0A0MQY5 61 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-203ENST00000474181 PP632Q6XCG6 107 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-203ENST00000474181 MT1BP07438 61 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.34□□□□□ -1.55
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1-203ENST00000474181 MT1XP80297 61 aa5.25□□□□□ -1.57
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP10-5P60370 271 aa5.24□□□□□ -1.57
UBE2Q1-203ENST00000474181 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2Q1-203ENST00000474181 LCE3AQ5TA76 89 aa5.15□□□□□ -1.59
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP10-12P60413 245 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.1□□□□□ -1.59
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.02□□□□□ -1.61
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP12-3P60328 96 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2Q1-203ENST00000474181 USH2AO75445 5202 aa4.9□□□□□ -1.62
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2Q1-203ENST00000474181 LUZP6Q538Z0 58 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2Q1-203ENST00000474181 NDUFAF8A1L188 74 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2Q1-203ENST00000474181 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2Q1-203ENST00000474181 LCE4AQ5TA78 99 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2Q1-203ENST00000474181 SSPOA2VEC9 5147 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2Q1-203ENST00000474181 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms