RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 USH2AO75445 5202 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf3-210ENST00000462125 SPINK7P58062 85 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf3-210ENST00000462125 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C9orf3-210ENST00000462125 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-210ENST00000462125 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-210ENST00000462125 MT2AP02795 61 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-210ENST00000462125 Q5W150 140 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2-30P06310 120 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf3-210ENST00000462125 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 MT1FP04733 61 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-10P60014 251 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 LCE2BO14633 110 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-210ENST00000462125 ACYP2P14621 99 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-210ENST00000462125 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 COA5Q86WW8 74 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 DMAC1Q96GE9 116 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 V9GYY9 64 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 A8MUN3 132 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-210ENST00000462125 Q1T7F1 81 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf3-210ENST00000462125 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-210ENST00000462125 C4orf26Q17RF5 130 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 NEBP20929 6669 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-210ENST00000462125 PRR15LQ9BU68 103 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf3-210ENST00000462125 PSPHP1O15172 72 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 S4R3F8 94 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 CSAG1Q6PB30 78 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 LCA10Q71F78 164 aa6.04□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 Q5VV11 94 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GU69 56 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf3-210ENST00000462125 SEC61GP60059 68 aa6□□□□□ -1.45
C9orf3-210ENST00000462125 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf3-210ENST00000462125 BRK1Q8WUW1 75 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 A6NED7 52 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 MT1BP07438 61 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 PRO0628Q9UI54 55 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 SVIPQ8NHG7 77 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-210ENST00000462125 UQCR11O14957 56 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-210ENST00000462125 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-210ENST00000462125 CRIPTQ9P021 101 aa5.86□□□□□ -1.47
C9orf3-210ENST00000462125 A6NN06 94 aa5.85□□□□□ -1.47
C9orf3-210ENST00000462125 H0YAA0 97 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-5P60370 271 aa5.81□□□□□ -1.48
C9orf3-210ENST00000462125 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GU33 70 aa5.77□□□□□ -1.49
C9orf3-210ENST00000462125 MDN1Q9NU22 5596 aa5.73□□□□□ -1.49
C9orf3-210ENST00000462125 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.71□□□□□ -1.5
C9orf3-210ENST00000462125 A8MU10 97 aa5.67□□□□□ -1.5
C9orf3-210ENST00000462125 PMAIP1Q13794 54 aa5.65□□□□□ -1.5
C9orf3-210ENST00000462125 KMT2DO14686 5537 aa5.64□□□□□ -1.51
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP5-9P26371 169 aa5.62□□□□□ -1.51
C9orf3-210ENST00000462125 K7ERS5 55 aa5.61□□□□□ -1.51
C9orf3-210ENST00000462125 M0QZ58 72 aa5.61□□□□□ -1.51
C9orf3-210ENST00000462125 P0C880 135 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf3-210ENST00000462125 MT1XP80297 61 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 R4GN34 69 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 PLAC4Q8WY50 150 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf3-210ENST00000462125 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.5□□□□□ -1.53
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.5□□□□□ -1.53
C9orf3-210ENST00000462125 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0D9SG42 100 aa5.45□□□□□ -1.54
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP12-2P59991 146 aa5.45□□□□□ -1.54
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01554Q52M75 96 aa5.4□□□□□ -1.54
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.4□□□□□ -1.54
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.38□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP12-1P59990 96 aa5.36□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.35□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR2EP22531 72 aa5.34□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR2BP35325 72 aa5.34□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 SPRR2AP35326 72 aa5.34□□□□□ -1.55
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.33□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.33□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 ROMO1P60602 79 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-12P60413 245 aa5.29□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.29□□□□□ -1.56
C9orf3-210ENST00000462125 PRAC1Q96KF2 57 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.4 ms