RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 A8MUN3 132 aa8.63□□□□□ -1.03
DDR1-241ENST00000460944 USH2AO75445 5202 aa8.61□□□□□ -1.03
DDR1-241ENST00000460944 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.58□□□□□ -1.04
DDR1-241ENST00000460944 LCE2BO14633 110 aa8.56□□□□□ -1.04
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.55□□□□□ -1.04
DDR1-241ENST00000460944 NDUFC1O43677 76 aa8.53□□□□□ -1.04
DDR1-241ENST00000460944 SSPOA2VEC9 5147 aa8.48□□□□□ -1.05
DDR1-241ENST00000460944 DMAC1Q96GE9 116 aa8.45□□□□□ -1.06
DDR1-241ENST00000460944 SERP2Q8N6R1 65 aa8.39□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.37□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 SNURFQ9Y675 71 aa8.37□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 H0YAA0 97 aa8.36□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.34□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 C20orf197Q8N268 126 aa8.34□□□□□ -1.07
DDR1-241ENST00000460944 ACYP2P14621 99 aa8.33□□□□□ -1.08
DDR1-241ENST00000460944 CRIPTQ9P021 101 aa8.31□□□□□ -1.08
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.29□□□□□ -1.08
DDR1-241ENST00000460944 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.28□□□□□ -1.08
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.24□□□□□ -1.09
DDR1-241ENST00000460944 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.24□□□□□ -1.09
DDR1-241ENST00000460944 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
DDR1-241ENST00000460944 Q5VV11 94 aa8.22□□□□□ -1.09
DDR1-241ENST00000460944 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.22□□□□□ -1.09
DDR1-241ENST00000460944 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.21□□□□□ -1.1
DDR1-241ENST00000460944 COX7CP15954 63 aa8.21□□□□□ -1.1
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.19□□□□□ -1.1
DDR1-241ENST00000460944 MT1BP07438 61 aa8.14□□□□□ -1.11
DDR1-241ENST00000460944 P0C880 135 aa8.1□□□□□ -1.11
DDR1-241ENST00000460944 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.08□□□□□ -1.12
DDR1-241ENST00000460944 R4GN34 69 aa8.08□□□□□ -1.12
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.05□□□□□ -1.12
DDR1-241ENST00000460944 M0QZ58 72 aa8.02□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 A6NN06 94 aa8.01□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 H7BZZ5 65 aa8□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 COA5Q86WW8 74 aa7.99□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.98□□□□□ -1.13
DDR1-241ENST00000460944 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP10-5P60370 271 aa7.92□□□□□ -1.14
DDR1-241ENST00000460944 PLAC4Q8WY50 150 aa7.91□□□□□ -1.14
DDR1-241ENST00000460944 LINC01554Q52M75 96 aa7.89□□□□□ -1.15
DDR1-241ENST00000460944 CCDC179H3BU77 68 aa7.86□□□□□ -1.15
DDR1-241ENST00000460944 SEC61GP60059 68 aa7.81□□□□□ -1.16
DDR1-241ENST00000460944 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.8□□□□□ -1.16
DDR1-241ENST00000460944 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.78□□□□□ -1.16
DDR1-241ENST00000460944 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
DDR1-241ENST00000460944 MT1XP80297 61 aa7.7□□□□□ -1.18
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.66□□□□□ -1.18
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.66□□□□□ -1.18
DDR1-241ENST00000460944 TMEM258P61165 79 aa7.63□□□□□ -1.19
DDR1-241ENST00000460944 A0A1B0GU69 56 aa7.61□□□□□ -1.19
DDR1-241ENST00000460944 A0A1B0GU33 70 aa7.6□□□□□ -1.19
DDR1-241ENST00000460944 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.53□□□□□ -1.2
DDR1-241ENST00000460944 A0A0D9SG42 100 aa7.51□□□□□ -1.21
DDR1-241ENST00000460944 NEBP20929 6669 aa7.49□□□□□ -1.21
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP12-2P59991 146 aa7.49□□□□□ -1.21
DDR1-241ENST00000460944 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.49□□□□□ -1.21
DDR1-241ENST00000460944 PRR15LQ9BU68 103 aa7.49□□□□□ -1.21
DDR1-241ENST00000460944 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.43□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.42□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 KMT2DO14686 5537 aa7.42□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.41□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-9P26371 169 aa7.41□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.41□□□□□ -1.22
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.36□□□□□ -1.23
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP12-1P59990 96 aa7.33□□□□□ -1.24
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP10-12P60413 245 aa7.33□□□□□ -1.24
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.3□□□□□ -1.24
DDR1-241ENST00000460944 A8MU10 97 aa7.29□□□□□ -1.24
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.28□□□□□ -1.24
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.27□□□□□ -1.25
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.27□□□□□ -1.25
DDR1-241ENST00000460944 MDN1Q9NU22 5596 aa7.22□□□□□ -1.25
DDR1-241ENST00000460944 UQCR11O14957 56 aa7.22□□□□□ -1.25
DDR1-241ENST00000460944 V9GYY9 64 aa7.19□□□□□ -1.26
DDR1-241ENST00000460944 PCP4P48539 62 aa7.16□□□□□ -1.26
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2EP22531 72 aa7.12□□□□□ -1.27
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2BP35325 72 aa7.12□□□□□ -1.27
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2AP35326 72 aa7.12□□□□□ -1.27
DDR1-241ENST00000460944 Q1T7F1 81 aa7.1□□□□□ -1.27
DDR1-241ENST00000460944 PSPHP1O15172 72 aa7.08□□□□□ -1.28
DDR1-241ENST00000460944 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.07□□□□□ -1.28
DDR1-241ENST00000460944 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.02□□□□□ -1.29
DDR1-241ENST00000460944 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.98□□□□□ -1.29
DDR1-241ENST00000460944 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
DDR1-241ENST00000460944 TNP1P09430 55 aa6.96□□□□□ -1.3
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.96□□□□□ -1.3
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.96□□□□□ -1.3
DDR1-241ENST00000460944 K7ERS5 55 aa6.94□□□□□ -1.3
DDR1-241ENST00000460944 A6NED7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
DDR1-241ENST00000460944 SPRR2DP22532 72 aa6.88□□□□□ -1.31
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.88□□□□□ -1.31
DDR1-241ENST00000460944 MT1EP04732 61 aa6.82□□□□□ -1.32
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.8□□□□□ -1.32
DDR1-241ENST00000460944 LCE3AQ5TA76 89 aa6.79□□□□□ -1.32
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.73□□□□□ -1.33
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.71□□□□□ -1.34
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.71□□□□□ -1.34
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