RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.4□□□□□ -1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 Q5VSD8 79 aa8.39□□□□□ -1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.36□□□□□ -1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 FAT1Q14517 4588 aa8.35□□□□□ -1.07
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.31□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.31□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.31□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.28□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SUCLG2-202ENST00000460567 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.21□□□□□ -1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 TNXBP22105 4242 aa8.19□□□□□ -1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1B0GU33 70 aa8.19□□□□□ -1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.17□□□□□ -1.1
SUCLG2-202ENST00000460567 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 HSPG2P98160 4391 aa8.13□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1HL1P0DM35 61 aa8.12□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.11□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.1□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 H0YAA0 97 aa8.09□□□□□ -1.11
SUCLG2-202ENST00000460567 RYR1P21817 5038 aa8.08□□□□□ -1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 TPRXLQ17RH7 258 aa8.08□□□□□ -1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 S4R3F8 94 aa8.06□□□□□ -1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 K7ERS5 55 aa8.05□□□□□ -1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.03□□□□□ -1.12
SUCLG2-202ENST00000460567 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.95□□□□□ -1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1DQ5T752 114 aa7.93□□□□□ -1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 RYR3Q15413 4870 aa7.91□□□□□ -1.14
SUCLG2-202ENST00000460567 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 PRAC1Q96KF2 57 aa7.89□□□□□ -1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.87□□□□□ -1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 CSAG1Q6PB30 78 aa7.84□□□□□ -1.15
SUCLG2-202ENST00000460567 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC01554Q52M75 96 aa7.8□□□□□ -1.16
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.79□□□□□ -1.16
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.76□□□□□ -1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 M0QZ58 72 aa7.74□□□□□ -1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 MYCBP2O75592 4640 aa7.73□□□□□ -1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ROMO1P60602 79 aa7.72□□□□□ -1.17
SUCLG2-202ENST00000460567 P0C880 135 aa7.71□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.71□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.71□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.68□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.67□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0D9SG42 100 aa7.65□□□□□ -1.18
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.63□□□□□ -1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SUCLG2-202ENST00000460567 LRP2P98164 4655 aa7.54□□□□□ -1.2
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP12-1P59990 96 aa7.51□□□□□ -1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP12-2P59991 146 aa7.49□□□□□ -1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.47□□□□□ -1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 R4GN34 69 aa7.46□□□□□ -1.21
SUCLG2-202ENST00000460567 LPAP08519 4548 aa7.45□□□□□ -1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 CRIPTQ9P021 101 aa7.44□□□□□ -1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC17Q685J3 4493 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.42□□□□□ -1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.41□□□□□ -1.22
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.38□□□□□ -1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.34□□□□□ -1.23
SUCLG2-202ENST00000460567 HERC2O95714 4834 aa7.29□□□□□ -1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE4AQ5TA78 99 aa7.29□□□□□ -1.24
SUCLG2-202ENST00000460567 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.24□□□□□ -1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.21□□□□□ -1.25
SUCLG2-202ENST00000460567 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.17□□□□□ -1.26
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.12□□□□□ -1.27
SUCLG2-202ENST00000460567 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.06□□□□□ -1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 PP632Q6XCG6 107 aa7.05□□□□□ -1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.03□□□□□ -1.28
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.99□□□□□ -1.29
SUCLG2-202ENST00000460567 HERC1Q15751 4861 aa6.95□□□□□ -1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.95□□□□□ -1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.94□□□□□ -1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.93□□□□□ -1.3
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.9□□□□□ -1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.88□□□□□ -1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 TNP1P09430 55 aa6.85□□□□□ -1.31
SUCLG2-202ENST00000460567 PLAC4Q8WY50 150 aa6.83□□□□□ -1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.83□□□□□ -1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 M0R2T5 61 aa6.82□□□□□ -1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1HP80294 61 aa6.79□□□□□ -1.32
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC2Q02817 5179 aa6.74□□□□□ -1.33
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-10P60014 251 aa6.66□□□□□ -1.34
SUCLG2-202ENST00000460567 MT2AP02795 61 aa6.65□□□□□ -1.34
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFAF8A1L188 74 aa6.63□□□□□ -1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1FP04733 61 aa6.61□□□□□ -1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.61□□□□□ -1.35
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF213Q63HN8 5207 aa6.56□□□□□ -1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 LUZP6Q538Z0 58 aa6.52□□□□□ -1.36
SUCLG2-202ENST00000460567 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.44□□□□□ -1.38
SUCLG2-202ENST00000460567 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.4□□□□□ -1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1BP07438 61 aa6.4□□□□□ -1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.38□□□□□ -1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.35□□□□□ -1.39
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-5P60370 271 aa6.33□□□□□ -1.4
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE3AQ5TA76 89 aa6.33□□□□□ -1.4
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.33□□□□□ -1.4
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1XP80297 61 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms