RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCE2CQ5TA81 110 aa7.47□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCA10Q71F78 164 aa7.47□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSAG1Q6PB30 78 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1HP80294 61 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 M0R2T5 61 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 V9GYY9 64 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q1T7F1 81 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 H0YAA0 97 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEC61GP60059 68 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1B0GU69 56 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRR15LQ9BU68 103 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PSPHP1O15172 72 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 P0C880 135 aa7.07□□□□□ -1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.05□□□□□ -1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT2AP02795 61 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1B0GU33 70 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q5VV11 94 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-10P60014 251 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1FP04733 61 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRIPTQ9P021 101 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UQCR11O14957 56 aa6.93□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 R4GN34 69 aa6.93□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 M0QZ58 72 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A6NED7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.81□□□□□ -1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.81□□□□□ -1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.79□□□□□ -1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC01554Q52M75 96 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A0D9SG42 100 aa6.74□□□□□ -1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A8MU10 97 aa6.74□□□□□ -1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.74□□□□□ -1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRK1Q8WUW1 75 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A6NN06 94 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCE2BO14633 110 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP12-1P59990 96 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 K7ERS5 55 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLAC4Q8WY50 150 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP12-2P59991 146 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1BP07438 61 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USH2AO75445 5202 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRO0628Q9UI54 55 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SSPOA2VEC9 5147 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1XP80297 61 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PMAIP1Q13794 54 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-5P60370 271 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.29□□□□□ -1.4
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.27□□□□□ -1.41
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ROMO1P60602 79 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNP1P09430 55 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-12P60413 245 aa6.01□□□□□ -1.45
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6□□□□□ -1.45
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRAC1Q96KF2 57 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PP632Q6XCG6 107 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCE3AQ5TA76 89 aa5.87□□□□□ -1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.84□□□□□ -1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.84□□□□□ -1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.76□□□□□ -1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KMT2DO14686 5537 aa5.74□□□□□ -1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.73□□□□□ -1.49
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SVIPQ8NHG7 77 aa5.67□□□□□ -1.5
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP12-3P60328 96 aa5.66□□□□□ -1.5
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP5-9P26371 169 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.57□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1EP04732 61 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms