RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRP2P98164 4655 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q8N9L7 120 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C9orf92A6NGG3 77 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COA5Q86WW8 74 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LPAP08519 4548 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H0Y9P7 68 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A8MWP4 228 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DSCR10P59022 87 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC00313P59037 77 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF213Q63HN8 5207 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1B0GVX0 72 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7EQZ3 153 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A8MU10 97 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A8MUU9 505 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.36□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.36□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.35□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCOTHQ58A44 107 aa4.35□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.33□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUC2Q02817 5179 aa4.32□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.32□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.32□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPINK7P58062 85 aa4.31□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUC17Q685J3 4493 aa4.31□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UQCR11O14957 56 aa4.3□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACYP2P14621 99 aa4.3□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1B0GU69 56 aa4.26□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HRES1P13985 223 aa4.26□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAC1Q96KF2 57 aa4.26□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.25□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.23□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.22□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCE4AQ5TA78 99 aa4.21□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ROMO1P60602 79 aa4.2□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q5W150 140 aa4.2□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSAG1Q6PB30 78 aa4.2□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.16□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMAC1Q96GE9 116 aa4.16□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.16□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.15□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV2-30P06310 120 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.13□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT1HP80294 61 aa4.11□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 K7ERS5 55 aa4.09□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.07□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0A0MQY5 61 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0R2T5 61 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.02□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.01□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.96□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.93□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 P0C880 135 aa3.92□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.92□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 S4R3F8 94 aa3.92□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1B0GU33 70 aa3.9□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT2AP02795 61 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.86□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT1FP04733 61 aa3.86□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H0YAA0 97 aa3.85□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFAF8A1L188 74 aa3.83□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP10-10P60014 251 aa3.83□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.83□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LUZP6Q538Z0 58 aa3.83□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRIPTQ9P021 101 aa3.8□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.72□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.7□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USH2AO75445 5202 aa3.69□□□□□ -1.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.64□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 R4GN34 69 aa3.61□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSPOA2VEC9 5147 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT1BP07438 61 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0QZ58 72 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLAC4Q8WY50 150 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PP632Q6XCG6 107 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP10-5P60370 271 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 331.1 ms