RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.34□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK7P58062 85 aa6.34□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCG22E2RYF7 251 aa6.33□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR15Q8IV56 129 aa6.32□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.3□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.28□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCR1Q9BZK8 76 aa6.28□□□□□ -1.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf197Q8N268 126 aa6.27□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASC2Q6XLA1 102 aa6.26□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.23□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.22□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLKP1Q107X0 134 aa6.22□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEBP20929 6669 aa6.21□□□□□ -1.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hDV103S1A0JD37 113 aa6.21□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.21□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.21□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.21□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf47Q569G3 176 aa6.19□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNURFQ9Y675 71 aa6.19□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFC1O43677 76 aa6.18□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM258P61165 79 aa6.18□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.15□□□□□ -1.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MP68P56378 58 aa6.15□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.15□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.15□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7BZZ5 65 aa6.14□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0Y9P7 68 aa6.12□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFS5O43920 106 aa6.12□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.12□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BPC8 53 aa6.11□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.09□□□□□ -1.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00208Q96KT6 92 aa6.09□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.05□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.04□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NN06 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.02□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV2-30P06310 120 aa6.02□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.01□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERP1Q9Y6X1 66 aa6□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT1BP07438 61 aa5.98□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q5W150 140 aa5.98□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.97□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.97□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.96□□□□□ -1.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q5VV11 94 aa5.96□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf26Q17RF5 130 aa5.94□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.94□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDN1Q9NU22 5596 aa5.93□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.92□□□□□ -1.46
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP5-9P26371 169 aa5.9□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-5P60370 271 aa5.9□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KMT2DO14686 5537 aa5.9□□□□□ -1.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S4R3F8 94 aa5.87□□□□□ -1.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.86□□□□□ -1.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSAG1Q6PB30 78 aa5.84□□□□□ -1.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCA10Q71F78 164 aa5.83□□□□□ -1.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COA5Q86WW8 74 aa5.78□□□□□ -1.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A0MQY5 61 aa5.76□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACYP2P14621 99 aa5.76□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMAC1Q96GE9 116 aa5.76□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.73□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.73□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.72□□□□□ -1.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRIPTQ9P021 101 aa5.71□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q1T7F1 81 aa5.7□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 V9GYY9 64 aa5.7□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.69□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MUN3 132 aa5.68□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.65□□□□□ -1.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR2EP22531 72 aa5.64□□□□□ -1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR2BP35325 72 aa5.64□□□□□ -1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR2AP35326 72 aa5.64□□□□□ -1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSPHP1O15172 72 aa5.59□□□□□ -1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.59□□□□□ -1.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR15LQ9BU68 103 aa5.58□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.57□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.55□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0YAA0 97 aa5.54□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT1XP80297 61 aa5.54□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.54□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.53□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.53□□□□□ -1.52
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.51□□□□□ -1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GU69 56 aa5.49□□□□□ -1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP12-2P59991 146 aa5.47□□□□□ -1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.47□□□□□ -1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRK1Q8WUW1 75 aa5.47□□□□□ -1.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRR2DP22532 72 aa5.45□□□□□ -1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLAC4Q8WY50 150 aa5.45□□□□□ -1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NED7 52 aa5.44□□□□□ -1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC61GP60059 68 aa5.44□□□□□ -1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRO0628Q9UI54 55 aa5.4□□□□□ -1.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 R4GN34 69 aa5.36□□□□□ -1.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.35□□□□□ -1.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCR11O14957 56 aa5.33□□□□□ -1.56
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