RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R2T5 61 aa8.22□□□□□ -1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 COA5Q86WW8 74 aa8.22□□□□□ -1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.21□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.21□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSAG1Q6PB30 78 aa8.2□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.18□□□□□ -1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.1□□□□□ -1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0YAA0 97 aa8□□□□□ -1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 LORP23490 312 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.95□□□□□ -1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT2AP02795 61 aa7.9□□□□□ -1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.9□□□□□ -1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC61GP60059 68 aa7.87□□□□□ -1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.85□□□□□ -1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-10P60014 251 aa7.84□□□□□ -1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1FP04733 61 aa7.84□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.84□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.83□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 V9GYY9 64 aa7.81□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GU69 56 aa7.8□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 P0C880 135 aa7.8□□□□□ -1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q1T7F1 81 aa7.77□□□□□ -1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR15LQ9BU68 103 aa7.77□□□□□ -1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRIPTQ9P021 101 aa7.77□□□□□ -1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.68□□□□□ -1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 R4GN34 69 aa7.68□□□□□ -1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GU33 70 aa7.65□□□□□ -1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QZ58 72 aa7.64□□□□□ -1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.64□□□□□ -1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSPHP1O15172 72 aa7.6□□□□□ -1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.6□□□□□ -1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q5VV11 94 aa7.55□□□□□ -1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UQCR11O14957 56 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.5□□□□□ -1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE2BO14633 110 aa7.48□□□□□ -1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01554Q52M75 96 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.46□□□□□ -1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NED7 52 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NN06 94 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0D9SG42 100 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1BP07438 61 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MU10 97 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLAC4Q8WY50 150 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP12-1P59990 96 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 USH2AO75445 5202 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP12-2P59991 146 aa7.21□□□□□ -1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ERS5 55 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRK1Q8WUW1 75 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-5P60370 271 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1XP80297 61 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.04□□□□□ -1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSPOA2VEC9 5147 aa6.99□□□□□ -1.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.87□□□□□ -1.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO0628Q9UI54 55 aa6.82□□□□□ -1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 ROMO1P60602 79 aa6.78□□□□□ -1.32
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNP1P09430 55 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-12P60413 245 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMAIP1Q13794 54 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.71□□□□□ -1.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.54□□□□□ -1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.54□□□□□ -1.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.51□□□□□ -1.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE3AQ5TA76 89 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 PP632Q6XCG6 107 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 KMT2DO14686 5537 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3BP1-201ENST00000420768 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-9P26371 169 aa6.34□□□□□ -1.39
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAC1Q96KF2 57 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP12-3P60328 96 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1EP04732 61 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.07□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1LQ93083 61 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2EP22531 72 aa6.05□□□□□ -1.44
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