RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-202ENST00000405333 S4R3F8 94 aa9.92□□□□□ -0.82
ODC1-202ENST00000405333 LCE2CQ5TA81 110 aa9.9□□□□□ -0.82
ODC1-202ENST00000405333 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ODC1-202ENST00000405333 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.79□□□□□ -0.84
ODC1-202ENST00000405333 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.72□□□□□ -0.85
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ODC1-202ENST00000405333 Q1T7F1 81 aa9.65□□□□□ -0.86
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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ODC1-202ENST00000405333 A6NN06 94 aa8.72□□□□□ -1.01
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP10-5P60370 271 aa8.38□□□□□ -1.07
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1-202ENST00000405333 ROMO1P60602 79 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.19□□□□□ -1.1
ODC1-202ENST00000405333 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.19□□□□□ -1.1
ODC1-202ENST00000405333 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.09□□□□□ -1.11
ODC1-202ENST00000405333 PRAC1Q96KF2 57 aa8.09□□□□□ -1.11
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ODC1-202ENST00000405333 TNP1P09430 55 aa8.07□□□□□ -1.12
ODC1-202ENST00000405333 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.03□□□□□ -1.12
ODC1-202ENST00000405333 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.99□□□□□ -1.13
ODC1-202ENST00000405333 KMT2DO14686 5537 aa7.94□□□□□ -1.14
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP10-12P60413 245 aa7.91□□□□□ -1.14
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.84□□□□□ -1.15
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.84□□□□□ -1.15
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.6□□□□□ -1.19
ODC1-202ENST00000405333 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.56□□□□□ -1.2
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.49□□□□□ -1.21
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
ODC1-202ENST00000405333 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.35□□□□□ -1.23
ODC1-202ENST00000405333 MT1EP04732 61 aa7.35□□□□□ -1.23
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.29□□□□□ -1.24
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP5-9P26371 169 aa7.23□□□□□ -1.25
ODC1-202ENST00000405333 MT1LQ93083 61 aa7.19□□□□□ -1.26
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.14□□□□□ -1.27
ODC1-202ENST00000405333 MDN1Q9NU22 5596 aa7.11□□□□□ -1.27
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