RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-202ENST00000405333 S4R3F8 94 aa9.92□□□□□ -0.82
ODC1-202ENST00000405333 LCE2CQ5TA81 110 aa9.9□□□□□ -0.82
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.33□□□□□ -1.08
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.19□□□□□ -1.1
ODC1-202ENST00000405333 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.19□□□□□ -1.1
ODC1-202ENST00000405333 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.09□□□□□ -1.11
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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ODC1-202ENST00000405333 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.03□□□□□ -1.12
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ODC1-202ENST00000405333 MT1EP04732 61 aa7.35□□□□□ -1.23
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.29□□□□□ -1.24
ODC1-202ENST00000405333 KRTAP5-9P26371 169 aa7.23□□□□□ -1.25
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ODC1-202ENST00000405333 MDN1Q9NU22 5596 aa7.11□□□□□ -1.27
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