RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-209ENST00000395789 H0Y9P7 68 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-209ENST00000395789 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 K7ERU9 68 aa6.24□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 LCA10Q71F78 164 aa6.24□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 MT-ATP8P03928 68 aa6.23□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 S4R3F8 94 aa6.23□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 C5orf47Q569G3 176 aa6.22□□□□□ -1.41
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C6orf48-209ENST00000395789 IMUPQ9GZP8 106 aa6.22□□□□□ -1.41
C6orf48-209ENST00000395789 USH2AO75445 5202 aa6.22□□□□□ -1.41
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C6orf48-209ENST00000395789 KLKP1Q107X0 134 aa6.2□□□□□ -1.42
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C6orf48-209ENST00000395789 MP68P56378 58 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 CSAG1Q6PB30 78 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-209ENST00000395789 SCGB1A1P11684 91 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-209ENST00000395789 H3BPC8 53 aa6.13□□□□□ -1.43
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C6orf48-209ENST00000395789 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.1□□□□□ -1.43
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C6orf48-209ENST00000395789 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.04□□□□□ -1.44
C6orf48-209ENST00000395789 DMAC1Q96GE9 116 aa6.03□□□□□ -1.44
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C6orf48-209ENST00000395789 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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C6orf48-209ENST00000395789 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.9□□□□□ -1.46
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C6orf48-209ENST00000395789 C20orf197Q8N268 126 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-209ENST00000395789 Q5VV11 94 aa5.87□□□□□ -1.47
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C6orf48-209ENST00000395789 ACYP2P14621 99 aa5.86□□□□□ -1.47
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C6orf48-209ENST00000395789 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.71□□□□□ -1.5
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C6orf48-209ENST00000395789 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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C6orf48-209ENST00000395789 SEC61GP60059 68 aa5.4□□□□□ -1.54
C6orf48-209ENST00000395789 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.4□□□□□ -1.54
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C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2BP35325 72 aa5.12□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 SPRR2AP35326 72 aa5.12□□□□□ -1.59
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.06□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 UQCR11O14957 56 aa5.04□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.03□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.03□□□□□ -1.6
C6orf48-209ENST00000395789 Q1T7F1 81 aa5.01□□□□□ -1.61
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.98□□□□□ -1.61
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