RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.06□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 Q75L30 129 aa6.06□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 MT1HL1P0DM35 61 aa6.04□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 ACYP2P14621 99 aa6.04□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 DMAC1Q96GE9 116 aa6.04□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 V9GYY9 64 aa6.04□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.02□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 Q1T7F1 81 aa6.02□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 C4orf26Q17RF5 130 aa6□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 A8MUN3 132 aa5.98□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.98□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.98□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.97□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
CTXN3-202ENST00000395322 SPINK7P58062 85 aa5.94□□□□□ -1.46
CTXN3-202ENST00000395322 MYCBP2O75592 4640 aa5.93□□□□□ -1.46
CTXN3-202ENST00000395322 TPRXLQ17RH7 258 aa5.92□□□□□ -1.46
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.88□□□□□ -1.47
CTXN3-202ENST00000395322 PSPHP1O15172 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CTXN3-202ENST00000395322 PRR15LQ9BU68 103 aa5.87□□□□□ -1.47
CTXN3-202ENST00000395322 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.85□□□□□ -1.47
CTXN3-202ENST00000395322 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.83□□□□□ -1.48
CTXN3-202ENST00000395322 Q5VV11 94 aa5.83□□□□□ -1.48
CTXN3-202ENST00000395322 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.82□□□□□ -1.48
CTXN3-202ENST00000395322 BRK1Q8WUW1 75 aa5.78□□□□□ -1.48
CTXN3-202ENST00000395322 HERC2O95714 4834 aa5.77□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GU69 56 aa5.77□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.76□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 PRO0628Q9UI54 55 aa5.75□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 A6NED7 52 aa5.74□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 SEC61GP60059 68 aa5.72□□□□□ -1.49
CTXN3-202ENST00000395322 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.69□□□□□ -1.5
CTXN3-202ENST00000395322 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.66□□□□□ -1.5
CTXN3-202ENST00000395322 S4R3F8 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CTXN3-202ENST00000395322 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.64□□□□□ -1.51
CTXN3-202ENST00000395322 LRP2P98164 4655 aa5.64□□□□□ -1.51
CTXN3-202ENST00000395322 UQCR11O14957 56 aa5.64□□□□□ -1.51
CTXN3-202ENST00000395322 LPAP08519 4548 aa5.61□□□□□ -1.51
CTXN3-202ENST00000395322 LCA10Q71F78 164 aa5.61□□□□□ -1.51
CTXN3-202ENST00000395322 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.56□□□□□ -1.52
CTXN3-202ENST00000395322 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.55□□□□□ -1.52
CTXN3-202ENST00000395322 A8MU10 97 aa5.53□□□□□ -1.52
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GU33 70 aa5.52□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 MUC17Q685J3 4493 aa5.52□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 CSAG1Q6PB30 78 aa5.51□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.49□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 PMAIP1Q13794 54 aa5.48□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.46□□□□□ -1.53
CTXN3-202ENST00000395322 H0YAA0 97 aa5.43□□□□□ -1.54
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CTXN3-202ENST00000395322 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.4□□□□□ -1.54
CTXN3-202ENST00000395322 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.39□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 HERC1Q15751 4861 aa5.39□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 A6NN06 94 aa5.39□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 K7ERS5 55 aa5.35□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 P0C880 135 aa5.35□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.35□□□□□ -1.55
CTXN3-202ENST00000395322 M0QZ58 72 aa5.32□□□□□ -1.56
CTXN3-202ENST00000395322 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.32□□□□□ -1.56
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.28□□□□□ -1.56
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0D9SG42 100 aa5.25□□□□□ -1.57
CTXN3-202ENST00000395322 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.25□□□□□ -1.57
CTXN3-202ENST00000395322 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CTXN3-202ENST00000395322 R4GN34 69 aa5.23□□□□□ -1.57
CTXN3-202ENST00000395322 MUC2Q02817 5179 aa5.19□□□□□ -1.58
CTXN3-202ENST00000395322 CRIPTQ9P021 101 aa5.15□□□□□ -1.58
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP12-1P59990 96 aa5.13□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.13□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 M0R2T5 61 aa5.12□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP12-2P59991 146 aa5.11□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01554Q52M75 96 aa5.11□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 RNF213Q63HN8 5207 aa5.1□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 ROMO1P60602 79 aa5.1□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.1□□□□□ -1.59
CTXN3-202ENST00000395322 MT1HP80294 61 aa5.08□□□□□ -1.6
CTXN3-202ENST00000395322 PRAC1Q96KF2 57 aa5.06□□□□□ -1.6
CTXN3-202ENST00000395322 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.99□□□□□ -1.61
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.94□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.94□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.94□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.93□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 MT2AP02795 61 aa4.92□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP10-10P60014 251 aa4.92□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CTXN3-202ENST00000395322 MT1FP04733 61 aa4.88□□□□□ -1.63
CTXN3-202ENST00000395322 PLAC4Q8WY50 150 aa4.86□□□□□ -1.63
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CTXN3-202ENST00000395322 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.82□□□□□ -1.64
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.81□□□□□ -1.64
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.77□□□□□ -1.65
CTXN3-202ENST00000395322 TNP1P09430 55 aa4.72□□□□□ -1.65
CTXN3-202ENST00000395322 PP632Q6XCG6 107 aa4.71□□□□□ -1.66
CTXN3-202ENST00000395322 LCE1EQ5T753 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CTXN3-202ENST00000395322 MT1BP07438 61 aa4.66□□□□□ -1.66
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFAF8A1L188 74 aa4.65□□□□□ -1.66
CTXN3-202ENST00000395322 MT3P25713 68 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.1 ms