RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-201ENST00000368202 LCA10Q71F78 164 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-201ENST00000368202 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-201ENST00000368202 M0R2T5 61 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRK-201ENST00000368202 LCE2CQ5TA81 110 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRK-201ENST00000368202 CSAG1Q6PB30 78 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-201ENST00000368202 MT1HP80294 61 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-201ENST00000368202 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-201ENST00000368202 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-201ENST00000368202 SEC61GP60059 68 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-201ENST00000368202 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-201ENST00000368202 V9GYY9 64 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GU69 56 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 PRR15LQ9BU68 103 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 H0YAA0 97 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 Q1T7F1 81 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-201ENST00000368202 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-10P60014 251 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-201ENST00000368202 P0C880 135 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-201ENST00000368202 PSPHP1O15172 72 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 MT2AP02795 61 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 CRIPTQ9P021 101 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GU33 70 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 R4GN34 69 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 MT1FP04733 61 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRK-201ENST00000368202 M0QZ58 72 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRK-201ENST00000368202 UQCR11O14957 56 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRK-201ENST00000368202 Q5VV11 94 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRK-201ENST00000368202 A6NED7 52 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01554Q52M75 96 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0D9SG42 100 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRK-201ENST00000368202 A8MU10 97 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 USH2AO75445 5202 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 PLAC4Q8WY50 150 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 A6NN06 94 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 K7ERS5 55 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-201ENST00000368202 BRK1Q8WUW1 75 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-201ENST00000368202 LCE2BO14633 110 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-201ENST00000368202 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP12-1P59990 96 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-201ENST00000368202 SSPOA2VEC9 5147 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 MT1BP07438 61 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP12-2P59991 146 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-201ENST00000368202 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRK-201ENST00000368202 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRK-201ENST00000368202 PRO0628Q9UI54 55 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-5P60370 271 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-201ENST00000368202 MT1XP80297 61 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-201ENST00000368202 PMAIP1Q13794 54 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-201ENST00000368202 ROMO1P60602 79 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-201ENST00000368202 TNP1P09430 55 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-12P60413 245 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-201ENST00000368202 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-201ENST00000368202 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-201ENST00000368202 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-201ENST00000368202 PP632Q6XCG6 107 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-201ENST00000368202 LCE3AQ5TA76 89 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-201ENST00000368202 PRAC1Q96KF2 57 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRK-201ENST00000368202 SVIPQ8NHG7 77 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-201ENST00000368202 KMT2DO14686 5537 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP12-3P60328 96 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-201ENST00000368202 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-201ENST00000368202 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP5-9P26371 169 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-201ENST00000368202 MDN1Q9NU22 5596 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRK-201ENST00000368202 NEBP20929 6669 aa4.49□□□□□ -1.69
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