RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAC1Q96KF2 57 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.02□□□□□ -0.8
SH3BP1-201ENST00000357436 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-201ENST00000357436 MT1HL1P0DM35 61 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-201ENST00000357436 LPAP08519 4548 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-201ENST00000357436 LRP2P98164 4655 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YAA0 97 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-201ENST00000357436 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP1-201ENST00000357436 HERC2O95714 4834 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GU33 70 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP1-201ENST00000357436 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.77□□□□□ -0.84
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SH3BP1-201ENST00000357436 J3QL48 77 aa9.54□□□□□ -0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-201ENST00000357436 K7ERS5 55 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-201ENST00000357436 S4R3F8 94 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.4□□□□□ -0.9
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SH3BP1-201ENST00000357436 P0C880 135 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0D9SG42 100 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-201ENST00000357436 CRIPTQ9P021 101 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.25□□□□□ -0.93
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SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP12-2P59991 146 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SH3BP1-201ENST00000357436 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP1-201ENST00000357436 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP12-1P59990 96 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP1-201ENST00000357436 M0QZ58 72 aa9.02□□□□□ -0.96
SH3BP1-201ENST00000357436 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.96□□□□□ -0.97
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BS24 57 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP1-201ENST00000357436 R4GN34 69 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP1-201ENST00000357436 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP1-201ENST00000357436 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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SH3BP1-201ENST00000357436 M0R2T5 61 aa8.47□□□□□ -1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 PLAC4Q8WY50 150 aa8.28□□□□□ -1.08
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SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.07□□□□□ -1.12
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SH3BP1-201ENST00000357436 TNP1P09430 55 aa8.03□□□□□ -1.12
SH3BP1-201ENST00000357436 USH2AO75445 5202 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP23-1A1A580 65 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 LUZP6Q538Z0 58 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP1-201ENST00000357436 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.8□□□□□ -1.16
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MT1BP07438 61 aa7.71□□□□□ -1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LCE3AQ5TA76 89 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 LCE2BO14633 110 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 KMT2DO14686 5537 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 MT1XP80297 61 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP10-5P60370 271 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0A0MQY5 61 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.46□□□□□ -1.21
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SH3BP1-201ENST00000357436 SSPOA2VEC9 5147 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP10-12P60413 245 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP12-3P60328 96 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1-201ENST00000357436 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-201ENST00000357436 INE1O15225 51 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-201ENST00000357436 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.74□□□□□ -1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.6□□□□□ -1.35
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