RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297623.6

C9orf24-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 24, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf24, Length 1,151 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf24-201ENST00000297623 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf24-201ENST00000297623 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 ACYP2P14621 99 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP10-10P60014 251 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 MT1FP04733 61 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf24-201ENST00000297623 PCP4P48539 62 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 H0YAA0 97 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 H7BZZ5 65 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 CCDC179H3BU77 68 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf24-201ENST00000297623 CRIPTQ9P021 101 aa6.85□□□□□ -1.31
C9orf24-201ENST00000297623 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf24-201ENST00000297623 COA5Q86WW8 74 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf24-201ENST00000297623 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf24-201ENST00000297623 LCE2BO14633 110 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf24-201ENST00000297623 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf24-201ENST00000297623 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf24-201ENST00000297623 TMEM258P61165 79 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf24-201ENST00000297623 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf24-201ENST00000297623 USH2AO75445 5202 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 P0C880 135 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 R4GN34 69 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 SEC61GP60059 68 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf24-201ENST00000297623 Q5VV11 94 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf24-201ENST00000297623 M0QZ58 72 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf24-201ENST00000297623 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf24-201ENST00000297623 SSPOA2VEC9 5147 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf24-201ENST00000297623 MT1BP07438 61 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf24-201ENST00000297623 A0A1B0GU69 56 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf24-201ENST00000297623 LINC01554Q52M75 96 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf24-201ENST00000297623 PLAC4Q8WY50 150 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf24-201ENST00000297623 PRR15LQ9BU68 103 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf24-201ENST00000297623 A0A1B0GU33 70 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf24-201ENST00000297623 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf24-201ENST00000297623 A6NN06 94 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf24-201ENST00000297623 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP10-5P60370 271 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 V9GYY9 64 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf24-201ENST00000297623 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf24-201ENST00000297623 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf24-201ENST00000297623 A0A0D9SG42 100 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf24-201ENST00000297623 Q1T7F1 81 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf24-201ENST00000297623 MT1XP80297 61 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf24-201ENST00000297623 UQCR11O14957 56 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf24-201ENST00000297623 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf24-201ENST00000297623 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf24-201ENST00000297623 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf24-201ENST00000297623 PSPHP1O15172 72 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP12-1P59990 96 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf24-201ENST00000297623 A8MU10 97 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP12-2P59991 146 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf24-201ENST00000297623 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf24-201ENST00000297623 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf24-201ENST00000297623 A6NED7 52 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf24-201ENST00000297623 K7ERS5 55 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP10-12P60413 245 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf24-201ENST00000297623 KMT2DO14686 5537 aa5.85□□□□□ -1.47
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP5-9P26371 169 aa5.85□□□□□ -1.47
C9orf24-201ENST00000297623 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf24-201ENST00000297623 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf24-201ENST00000297623 TNP1P09430 55 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf24-201ENST00000297623 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.77□□□□□ -1.49
C9orf24-201ENST00000297623 BRK1Q8WUW1 75 aa5.74□□□□□ -1.49
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.69□□□□□ -1.5
C9orf24-201ENST00000297623 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.69□□□□□ -1.5
C9orf24-201ENST00000297623 NEBP20929 6669 aa5.64□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 SPRR2EP22531 72 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 SPRR2BP35325 72 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 SPRR2AP35326 72 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 ROMO1P60602 79 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 LCE3AQ5TA76 89 aa5.59□□□□□ -1.51
C9orf24-201ENST00000297623 MDN1Q9NU22 5596 aa5.58□□□□□ -1.52
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.57□□□□□ -1.52
C9orf24-201ENST00000297623 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.55□□□□□ -1.52
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf24-201ENST00000297623 PRO0628Q9UI54 55 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf24-201ENST00000297623 MT1EP04732 61 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP12-3P60328 96 aa5.42□□□□□ -1.54
C9orf24-201ENST00000297623 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms