RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 XP32Q5T750 250 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2-30P06310 120 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 HRES1P13985 223 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01554Q52M75 96 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 LRP2P98164 4655 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 TPRXLQ17RH7 258 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.97□□□□□ -1.61
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RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFAF8A1L188 74 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGEF1-201ENST00000284957 M0QZ58 72 aa4.28□□□□□ -1.73
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RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.42□□□□□ -1.86
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RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
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